基于核酸外切酶Ⅲ辅助信号放大的化学发光共振能量转移体系高灵敏检测核酸

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DNA检测在医学诊断、司法鉴定、食品安全等领域扮演着重要角色。发展高灵敏度、高选择性的DNA检测分析系统己成为生命分析化学的研究热点之一。本研究在化学发光共振能量转移体系中,引入核酸外切酶Ⅲ辅助的信号放大和具有高效猝灭能力的氧化石墨烯,建立了超高灵敏度检测DNA的新方法。具体工作内容如下:一、基于核酸外切酶Ⅲ辅助信号放大的化学发光共振能量转移体系高灵敏检测DNA基于氧化石墨烯的高效猝灭性能和核酸外切酶III辅助的信号循环放大,我们建立了一种超灵敏、高选择性、低成本检测DNA的化学发光方法。以5’端标记荧光素的ssDNA作为探针,并将其吸附于氧化石墨烯表面。当目标ssDNA存在时,与探针杂交形成dsDNA,脱离氧化石墨烯表面。核酸外切酶III作用于所形成的dsDNA,沿3’→5’方向催化探针DNA水解逐步去除单核苷酸,同时释放出荧光素和目标ssDNA;目标ssDNA与氧化石墨烯表面的探针杂交,进入下一循环;一个目标ssDNA经过多次循环,可产生多个游离荧光素,从而使信号得到放大;最后,通过鲁米诺—过氧化氢—辣根过氧化物酶化学发光体系对生成的游离荧光素进行检测,对目标DNA进行定量分析。在优化的实验条件下,目标DNA浓度在0.01pM-1.0pM范围内,与化学发光强度呈良好的线性关系,方法检出限为9fM。与没有加入核酸外切酶III相比,检出限降低了大约11倍。与基于核酸外切酶III辅助信号放大的荧光共振能量转移体系检测DNA相比,此化学发光共振能量转移体系的检出限低3个数量级。二、基于核酸外切酶III辅助信号放大的化学发光共振能量转移体系高灵敏检测DNA甲基化及DNA甲基转移酶活性本文使用亚硫酸氢钠处理甲基化的ssDNA和正常的ssDNA,正常的胞嘧啶成为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不受影响,这样就形成了两条不同的核酸序列。在鲁米诺—过氧化氢—辣根过氧化物酶—荧光素化学发光共振能量转移体系中,基于氧化石墨烯的高效猝灭性能和核酸外切酶III辅助的信号放大,以甲基化ssDNA的互补序列(5’端标记荧光素)作为探针,吸附于氧化石墨烯表面,建立了一种高灵敏度、低成本检测DNA甲基化及DNA甲基转移酶活性的化学发光方法。在优化的实验条件下,本方法检测DNA甲基化的检出限为0.002%,检测DNA甲基转移酶的检出限为0.008U/mL。
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