仿石鲈科Haemulidae鱼类隶属鲈形目Perciformes鲈亚目Percoidei鲈总科Percoidae。在形态学分类上,仿石鲈科许多种属的分类存在争议。本研究利用线粒体DNA基因16S rRNA以及核DNA基因TMO-4C4作为分子遗传标记,通过测定分布于中国仿石鲈科(Haemulidae),蜊科(Theraponidae),眶棘鲈科(Scolopsidae),金线鱼科(Nemipteridae)25种鱼类16S rRNA基因以及TMO-4C4基因部分序列,加上从GenBank下载的6个种类总共31种鱼类的序列一起利用Clustal W进行序列比对,利用Mega4.0,Paup Version4.0b10和MrBayes3.1.2等相关分子生物学软件对序列进行分析并构建系统发育树,从分子水平上揭示仿石鲈科鱼类的系统分类关系。结果如下:　　 利用NJ,MP,BI法基于16S rRNA以及TMO-4C4部分序列构建的系统发育树中,仿石鲈科6个属的种类并没有形成单系群,髭鲷属与其他5个属的亲缘关系较远,独自形成一类群。鯻科,眶棘鲈科种类与仿石鲈科种类也未能形成单系群,在系统进化树上鱼刺科与舵鱼科聚成一类群,眶棘鲈科都与金线鱼科聚成一类群,可知,鯻科,眶棘鲈科与仿石鲈科亲缘关系相对较远。此外,在仿石鲈科种类中,胡椒鲷属的种类也没有形成单系群,在所有系统进化树上,少棘胡椒鲷都位于胡椒鲷属的内部,花尾胡椒鲷最先分化出来,位于该分支基部。因此,本研究结果不支持鯻科,眶棘鲈科归为仿石鲈科的观点。同时,少棘胡椒鲷与胡椒鲷的亲缘关系较近,应该归为胡椒鲷属,髭鲷属与仿石鲈科其他属的关系较远,应从仿石鲈科中划分出去比较合适。　　 试验测得斜带髭鲷线粒体基因组序列全长16478bp,其结构由22个tRNA,2个rRNA,13个编码蛋白基因和1个非编码的控制区所组成,与大部分的硬骨鱼类的线粒体基因组的结构和长度相似。基于线粒体基因组中16S rRNA全长序列的50种鲈亚目的种类的系统进化分析发现,鲈亚目27个科的种类大致分成6个类群,其中斜带髭鲷没有与仿石鲈科种类聚在一起,而是位于不同的类群,斜带髭鲷与与龙占科Lethrinidae,弱棘鱼科Malacanthidae与刺盖鱼科Pomacanthidae的种类聚在一起,显示其与它们有比较近的亲缘关系,初步确定髭鲷属在鲈亚目中的分类地位。