柑桔溃疡病（Citrus Canker）是严重危害世界柑桔产业的一种细菌性病害,病原为地毯草黄单胞杆菌柑桔致病变种[Xanthomonas axonopodis pv.Citri（Xac）]。该病能感染大多数栽培柑桔品种,导致落叶、落果、树势衰弱、果实生锈斑和品质变劣,甚至树体死亡,增加了生产成本、降低了商品价值。培育和利用抗溃疡病的柑桔品种,是从根本上解决溃疡病危害的有效而彻底的方法,但受到抗性机理研究不够深入、常规育种转移抗性基因面临多重困难,以及可利用外源抗性基因有限等因素的制约,目前柑桔抗溃疡病品种的培育,尤其是生产上大量栽培的甜橙、葡萄柚等敏感品种的改良仍进展甚微,迫切需要对溃疡病抗性进行深入研究。分子标记技术为深入开展柑桔溃疡病研究提供了一条途径。本试验采用抗柑桔溃疡病的宜昌橙2586×易感病的岭南沙田柚F1代为试材,开展抗溃疡病分子标记筛选。首先,随机选取80株F1代材料,在疫区进行溃疡病田间接种鉴定,按标准5级抗性评价程序分级评价;其次,为了与分子标记评价结果进行对照分析,将免疫和高抗类型作为抗性类型,中抗、中感和感病作为敏感类型进行简化分析,并对该简化分离结果进行卡方检验。随后,根据集合分离分析法BSA（Bulked Segregant Analysis）,分别选取8个极端抗病单株和极端感病单株组建抗感基因池,通过SSR和SRAP等分子标记技术,建立适合柑桔的分子标记体系,开展与该病抗性相关的分子标记筛选。对基因池筛选获得的差异引物组合,进行亲本和抗感池个体的进一步鉴定,鉴定的标记作为可能的抗性候选标记,并将该候选标记对鉴定的分离群体进行进一步验证,将其结果与抗性鉴定结果进行相关分析,采用最大似然法计算遗传距离。最后,为了更深入验证所获得的标记,选用生产上比较公认的溃疡病抗感性类型材料,进行扩增检测。通过上述研究,获得以下主要研究结果:（1）田间抗性鉴定表明,宜昌橙2586×岭南沙田柚的F1代材料抗性分离明显,80株材料除2株死亡外,免疫（1）5株,高抗（HR）37株,中抗（MR）31株,中感（MS）3株和高感（S）2株。简化为抗感2级分析,有42株抗病,36株感病。经卡方检验,x²=0.16远小于x²_0.05=3.84,抗感性状分离符合1:1比例,表明此条件下该性状的遗传符合孟德尔规律。（2）建立比较稳定且适于BSA法标记筛选的柑桔SSR和SRAP扩增检测体系,从285对SSR引物组合中筛选到26对在抗感基因池间表现多态性的引物,从360对SRAP引物组合中筛选到67对在抗感基因池间表现出多态性引物。（3）通过基因池个体验证,从26对SSR多态性引物组合中找到了一个可能与柑桔溃疡病抗性相关基因连锁的标记,将其命名为CR14-110。该标记在8个抗病基因池单株和8个感病基因池单株及亲本间表现与抗性相关的多态性。进一步对测试分离群体进行单株验证,表现抗病的42个单株中,有3株未出现该特征片段;表现感病的36个单株中,有6株出现该特征片段。经CORREL函数相关分析,该标记与柑桔溃疡病抗性的相关系数为0.79,采用最大似然法计算重组率为（9.38±3.5%）,通过Kosambi函数将其转换成图距单位（cM）,遗传距离为9.11cM。（4）通过有代表性的柑桔及其近缘属种类验证表明,在公认感病的甜橙、柚、枳及其杂种中没有CR14-110标记;抗病的宜昌橙、宽皮柑桔、金柑、香橙的多数材料出现此标记。