本文采用高效液相色谱-三重四级杆质谱联用系统（HPLC-QqQ-MS）分析一个时期内不同营养盐浓度对海水围塘微藻群落结构的影响。1.建立一个基于液相色谱三重四级杆质谱定量分析色素含量的分析方法。以叶绿素a、叶绿素b、β,β-胡萝卜素、叶黄素和岩藻黄素及其他特征色素为研究对象，通过化合物的质谱学规律，鉴定色素种类；以选择反应模式（SRM）对上述色素进行定量分析。结果显示，已开发的方法灵敏度高、回收率高、重复性好，并利用该方法对赤潮异弯藻，卡罗藻，微小原甲藻，微拟球藻，蛋白核小球藻，颗石藻，定鞭金藻，中肋骨条藻，威氏海链藻和假微型海链藻中的色素种类和含量进行了分析研究，明确不同藻中的色素分布情况。2.结合液质联用方法测定的色素种类和含量，及通过色素含量计算藻群组成公式，在围塘中检测到硅藻、甲藻、绿藻、青绿藻、金藻、定鞭金藻、隐藻、蓝藻和原绿藻，其中硅藻、甲藻和绿藻为优势藻种，而金藻、定鞭金藻、隐藻和蓝藻含量较低。添加营养盐后，围塘中群落结构发生了变化。在添加营养盐的围塘中，浮游藻类生物量为：添加N/P/Si为96/6/30μmol/L的围塘里＞添加30μmol/L Si围塘＞未添加营养盐的空白围塘，表明添加N/P/Si能够促进藻类生长，其中添加N/P/Si后围塘中硅藻和绿藻百分含量增加明显，绿藻百分含量增加更为明显，而金藻、定鞭金藻和甲藻百分含量有所下降；只添加Si的围塘中硅藻百分含量＞添加N/P/Si围塘＞空白围塘，表明Si对硅藻的生长促进作用，在N/P/Si均充足时硅藻受到种间竞争影响而生长有所抑制。总之，本论文构建了基于液质联用技术快速筛选围塘中浮游藻类群落结构的分析方法，为后续对海洋浮游藻类群落分布和贝类饵料营养筛选等研究奠定了基础。