深色有隔内生真菌(DSE)重金属抗性菌株Exophiala pisciphila (H93)Zip基因的克隆与功能分析

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:skt023
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
云南素有“有色金属王国”的美誉,然而历史上矿产资源的无序开采导致矿区重金属污染严重,特别是土壤镉(Cd)污染已成为当地的重大环境问题。本实验室前期研究发现,会泽县者海镇镉(Cd)严重污染的铅锌矿区,常有深色有隔内生真菌(Dark septate endophyte, DSE)定殖于自然生长的植物根部,并且对重金属镉(Cd)表现出很强的耐性和抗性,DSE在促进植物适应重金属胁迫的矿区环境中很可能发挥着重要作用。因此研究DSE对镉的耐性及其相关机理,有利于阐明DSE在重金属严重污染的特殊生态系统中的功能地位,进而诠释Cd污染矿区DSE与植物重金属耐性的关系。Zip转运蛋白家族(Zinc regulating transport protein and iron regulating transport protein, Zip)是一类种类繁多、分布广泛、转运底物多样的跨膜转运器。已有的研究表明Zip转运家族与二价金属阳离子的转运有密切的联系,但是真菌中只有少数几个物种的Zip转运蛋白基因得到克隆并验证了功能,DSE中有关Zip家族基因的克隆和功能研究尚未见报道。本论文以分离自会泽铅锌矿区的嗜鱼外瓶霉(Exophiala pisciphila, ACCC32496,实验室编号为H93)为研究对象,利用454转录组高通量测序技术,对在无重金属Cd胁迫和Cd浓度为EC50的重金属胁迫条件下培养的H93菌株进行转录组测序,发现其中有41个基因功能注释为Zip基因家族相关基因,通过选取差异表达最为显著的comp6001基因(GenBank accession: KR270804)为目的基因,对其进行克隆、生物信息学分析、酵母异源互补功能验证、亚细胞定位和不同重金属胁迫条件下差异表达分析,得出以下结果:1. EpZip1基因的克隆与生物信息学分析采用反转录PCR技术克隆出comp6001基因的开放阅读框(ORF),将其命名为EpZip1,该ORF全长1578bp,可编码525个氨基酸,合成蛋白EpZIP1的分子量约为55.4kDa,等电点pI约为5.2。生物信息学分析结果表明组成该蛋白的氨基酸大部分为疏水性氨基酸,含有1个信号肽和Zip家族典型的8个跨膜结构域,预测表明其表达部位仅为细胞膜,可初步推断其为跨膜转运蛋白。系统进化分析表明该基因与其他不同来源的Zip基因家族成员有较高的同源性。2. EpZip1基因的功能验证采用酵母功能互补验证方法,将comp6001基因cDNA-ORF区(即EpZip1基因)融合到特异性表达质粒pFL61中,构建重组质粒。利用醋酸锂转化法,通过野生型酵母DY1457、铁缺陷型酵母DHY1453和锌缺陷型酵母ZHY3在特定筛选培养基上的生长状况,对EpZip1基因编码蛋白EpZIP1进行Zn、Fe转运功能验证。发现EpZip1基因的表达使得锌转运缺陷型酿酒酵母(Saccharomyces Cerevisiae)在低锌(EDTA螯合)培养基恢复生长,但转化的重组子酵母却在低铁(BPDS螯合)培养基无法生长。我们的结果表明EpZip1发挥部分或者完全的转运锌离子的功能,但不能吸收和转运二价铁离子。3. EpZipl基因亚细胞定位与表达分析通过构建含有comp6001基因cDNA-ORF区(即EpZip1基因)的重组pDDGFP-2质粒,使其在酿酒酵母ZHY3中诱导表达,荧光显微镜观察结果表明EpZip1基因所编码蛋白定位在细胞膜上。qRT-PCR研究结果表明,在重金属Cd2+、 Zn2+胁迫处理条件下,随着重金属浓度的升高,H93菌株中EpZip1基因分别呈现出了不同程度的下调表达趋势,EpZip1基因的表达受细胞外二价阳离子Cd2+、Zn2+浓度的调控。EpZip1基因编码蛋白EpZIP1在H93中可能起到将胞外二价阳离子吸收或转运到胞内的功能。
其他文献
农村合作金融是我国农村金融体系的重要组成部分,是支持服务“三农”的重要力量。在我国,农村合作金融的历史非常悠久,距今已经有一千年左右的历史,可以追溯至“合会”等民间金融的形式。目前,我国的农村合作金融组织大致可分为三类:民间合作金融组织、农村信用合作社及农村合作银行,其中农村信用合作社是我国农村合作金融的主要组织形式。本文主要以农村信用合作社为研究对象,对其发展模式产权特征和优缺点进行了简要分析。
<正> 一、自然力对社会生活的影响“自然力”这一范畴所包括的内容是多方面的,马克思主义经典作家也是在多种意义上使用这一范畴.如马克思在谈到资本主义生产方式下的协作和
<正>唐宋八大家即韩愈、柳宗元、欧阳修、曾巩、苏洵、王安石、苏轼和苏辙,作为唐宋古文运动的八位重要人物,彼此之间既有相同点又有差异。文学成就方面,宋代的欧苏与韩柳旗
会议
目前,随着我国经济的快速发展,对各种能源的需求也不断的增多,在现代建筑设计的过程中,必须加强对建筑行业电气节能设计的重视。因为国民经济的快速发展,人们对电气的要求不
<正> 杰克·顾迪(英国剑桥大学教授,英国皇家科学院院士).首先,我想感谢邀请我来讲演的东道主——广东历史学会.由于在座的都是历史学界、人类学界和社会科学界的同仁,我想利
针对军事网络人才培养没有综合能力评估体系,缺乏对其培养、选拔、使用进行科学管理的问题,根据其各种指标在系统设计、开发和使用中权重的不同,提出了基于过程的动态权重分
<正>中国工程建设标准化协会公路分会近年来在组织机构建设、为交通运输部服务和行业标准化管理等方面做了一些工作,一些心得与体会与大家分享,也请大家批评指正。1公路工程
3D打印技术是当前国内外机器人领域、先进制造等领域研究的热点之一,作为第三次工业革命的重要生产工具,3D打印技术在未来将会取得长足的进步。3D打印机作为实现3D打印技术的
为了解无人机在台风灾后应急巡检中可以发挥的作用和应用局限,在2014年第14号台风"海鸥"登陆湛江地区以后,运用3种比较主流的电力巡检无人机开展了巡检工作,对闪络故障点、线
大众需求使得建筑各项建设标准逐步提升,而绿色建筑的出现与生活需求十分契合。该理念主要是在建筑寿命期中,对节电、水、土地等进行最优处理,同时使建筑空间更为舒适。绿色