水稻是一种半水生植物，耐淹涝能力较强，但长期涝渍和没顶淹涝仍然会对水稻的生长发育造成严重的危害，甚至死亡，从而导致大幅度减产。淹涝胁迫会使水稻从有氧的环境进入缺氧的环境，环境条件的改变会引起基因表达的变化，进而导致一系列生理代谢变化。本论文通过对乙醇发酵过程中的关键基因Adh2 在淹涝胁迫下表达量的变化和耐淹涝相关EST标记的研究，获得如下研究结果： 1、耐淹涝材料FR13A在苗期进行淹涝处理，乙醇脱氢酶基因Adh2在淹涝胁迫处理前期持续增加，但前4小时表达量较低，从第4小时开始大幅度提高，在第8小时表达量最大，随后稳定下降。淹涝胁迫能诱导叶片中Adh2基因大量表达，且呈低－高－低的变化趋势。 2、根据淹涝胁迫下在FR13A中特异表达的11 条片段进行引物设计，在FR13A（耐淹）和IR39595-503-2-1-2（敏感）中进行PCR扩增，其中有10对引物能扩增出产物。DF7和DF9在两亲本间有差异，且DF9在耐淹亲本及F4代耐淹个体中可扩增出200bp左右的特异性条带，认为DF9可以作为与耐淹涝性状连锁的EST标记。