甲型流感病毒是一种由脂质分子包覆的球状病毒,在病毒的表面分布有血凝素(hemagglutinin,简称HA蛋白)和神经氨酸酶(neuraminidase,简称NA蛋白)两种蛋白质。一般认为,在流感病毒进入宿主细胞时,HA蛋白的功能是与细胞表面的唾液酸连接,使病毒粘连在宿主表面并随着内吞作用进入宿主体内,在完成新病毒繁殖后,NA蛋白则负责将新病毒从宿主细胞释放。近年来一些实验现象表明,在病毒进入宿主的过程中,NA蛋白也会影响HA蛋白功能的发挥,但是由于方法的限制,还没有学者对这两种蛋白之间的相互作用进行深入研究。本文使用距离矩阵和相关性系数,对HA蛋白和NA蛋白的进化过程进行了比较,发现二者具有较高的相关性,这说明HA蛋白和NA蛋白在功能上存在相互作用。随后,本文将HA蛋白和NA蛋白的序列进行划分,使用相同的方法计算各个片段之间在进化过程中的相关性,实现对两蛋白相互作用位点的搜索。最后,本文应用所找到的位点,对HA蛋白和NA蛋白发生相互作用的过程进行了分子动力学模拟,并计算了两个蛋白质在接触界面上的结合能,与实际情况下的疫情观测结果进行比较,发现两者相符,证明预测的结果是可信的。