D2-43病毒株全序列测定与NS1基因的及保护研究

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 解放军军事医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyibi1987
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该研究以中国1987年从广西一登革热患者血清中分离的D2-43株为对象,对其进行了基因组全序测定.并与从DHF病人血清中分离的D2-04株序列比较,结果表明D2-43株基因组全长10723个核苷,含有单一的开放读码框,编码3391个氨基酸,5和3端非编码区分别为96个核苷酸和454个核苷酸.D2-43株与D2-04株核苷酸序列的同源性为95.1﹪,氨基酸序列的同源97.6﹪,不存在特别的高变区.这两株序列中共有83个核苷酸的变化导致了氨基酸的变化,其中结构区有26个,非结构区有57个.其中5 NTR的第59位核苷酸,3NTR的15个差异核苷酸,prM蛋白的第28位氨基酸,E蛋白的第126位氨基酸,NS1蛋白的246位、261位及347位氨基酸为可能引起毒力改变的位点.基因型分析结果表明D2-43株与引起DF的新几内亚(NGC)株均属Ⅱ型,而D2-04株的基因型为Ⅲ型,表明这国存在不同基因型的登革2型病毒感染.
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