目的：观察寒、热性中药对正常大鼠机体的影响,探讨中药寒热药性与药效之间的关系；采集寒、热性中药HPLC图谱,从中药整体化学信息角度探求中药寒热药性与中药物质成分之间的关系；观察同味寒性药或热性药不同提取成分对证治疗虚热证、虚寒证大鼠的效果差别,探讨寒热药性、药效与物质成分的关系。方法：选取中医公认、古今寒热药性无异议的典型寒、热性中药为样品,采集正常大鼠给药后的药物效应指标数据,单因素分析确定单个指标与寒热药性的相关性,利用基因芯片获取大鼠肝全基因表达谱数据,筛选表达发生显著变化的基因,查询其功能和表达通路,并用贝叶斯网络对实验数据进行数据挖掘；从典型寒、热性中药物质成分HPLC图谱数据库中通过压缩、降维、静噪处理后,抽取96个药性特征标记作为寒、热中药调理热证、寒证的物质成分代表,并选取对药性特征标记整体识别率最高的PLS-DA模型,测试其回代正确率和寒热药性判别正确率,并在此基础上用贝斯网络对寒热药性与药性特征标记关联关系进行数据挖掘；从寒性药知母和热性药干姜的寒、热药性特征标记聚集区分别提取其主要寒性和热性物质组分,将知母提取物及其水煎液用于治疗虚热证大鼠,干姜提取物及其水煎液用于治疗虚寒证大鼠,并采集大鼠药物效应指标数据进行单因素分析。结果：分别建立了“正常大鼠药物效应指标与寒热药性相关性的贝叶斯网络”、“中药寒热药性与正常大鼠肝全基因表达改变关联关系的贝叶斯网络”和“中药寒热药性与药性特征标记的关联关系贝叶斯网络”,图形化显示了中药寒热药性与药物效应指标、中药寒热药性与肝基因表达显著改变之间的因果关系及起效通路,以及中药寒热药性与药性特征标记之间的配伍模式和组合通路,并且三个贝叶斯网络通过不同指标变量均可进行中药寒热药性预测；同时,网络拓扑结构分析表明：寒、热特征标记结构明显,呈现出明显的模块化结构。即热性物质聚集在一起,形成特定的成分搭配模式和通路；寒性物质的模块内,尽管夹杂着一些热性标记,但这些热性标记均非网络的关键节点且处于网络的外围,因此,其搭配模式的模块化和通路也较明显。结论：寒、热性中药不仅能使机体病理状态下的寒热偏盛得到纠正,作用于正常机体后也能引起正常机体寒热效应,且相同药性中药的起效通路有相似性；任一中药内均含有寒性或热性物质组分,相同药性中药的物质组分在配伍模式上和组合通路上存在共性,中药寒或热的药性的产生是由该药所含所有物质成分组合搭配后整体显示,某一种物质成分或某单一药效作用均不能表征某味中药的整体药性。一味中药也是一个“复方”,其内不同成分在质和量上的搭配组合才能表征其整体药性的“寒”或“热”；同味药主要寒性物质组分和主要热性物质组分对同一病证治疗效果存在较大差异,热性药的主要热性成分、寒性药的主要寒性成分与中药水煎液药效相当,热性药的主要寒性成分、寒性药的主要热性成分药效甚微。同时,贝叶斯网络可有机结合先验知识和观测数据,通过概率计算推理网络节点变量间的因果关系及条件相关关系,并将结果图解可视化,是进行中药药性、药效和物质成分相关性研究的有效数据挖掘方法。