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目的：斗鸡是我国古老的家禽品种和稀有种质资源，经过长期选育纯化程度高，具有极强的攻击性且其攻击性能稳定的遗传给后代。长期以来吐鲁番斗鸡的选育主要是传统的表型选择，分子遗传育种工作尚未见报道，加之养殖分散，养殖数量锐减，2006年被列入国家级畜禽遗传资源保护品种名录，已成为珍稀的品种资源。为有效保护与开发利用吐鲁番斗鸡，本研究对吐鲁番斗鸡，新罗曼母鸡和杂交F1代进行分子遗传标记研究，以期找到与暴力攻击行为相关的标记基因。方法：本研究分别采用人工授精技术和自然交配两种方法分批进行吐鲁番斗鸡（♀）×新罗曼母鸡（♀）实验，以MAOA和5-HT受体基因为候选基因对三种群体进行PCR-SSCP分析。结果：（1）自然交配所得的F1代杂交种蛋169枚，经孵化检测受精率最高为100%最低为57.89%，活胚率最高为100%最低为52.63%。采用人工授精方法所得的F1代杂交种蛋174枚，受精率最高为100%最低为85.71%，活胚率最高为89.47%最低为75.0%。经X2检验受精率差异显著，说明人工授精确实可以提高受精率。（2）采用PCR-SSCP方法对三种群体进行MAOA基因的12个外显子多态性进行分析，在第2、3、4、5、10、13外显子上发现了多态性位点。结果分析第2外显子的突变可作为吐鲁番斗鸡攻击行为选择的候选基因。（3）采用PCR-SSCP方法对三种群体进行5-HT受体基因的3个外显子进行多态性分析，在第1和第3外显子上发现了多态性位点。结果分析第1外显子的突变可作为吐鲁番斗鸡攻击行为选择的候选基因。结论：吐鲁番斗鸡攻击行为与MAOA和5-HT受体基因具有一定的相关性，并且各有一个位点可作为吐鲁番斗鸡攻击行为选择的分子标记，为选育攻击行为更强的吐鲁番斗鸡提供分子依据。