本文分析和探讨了当前高校财务中面临的两个突出问题—赤字预算风险和债务风险，并以债务风险作为当前高校财务风险的重点来加以分析和评价。在赤字预算风险分析中，将赤字预算风险归纳为体制性突破、隐性突破和操作性突破三个方面，这种预算的外部性应通过完善现行高校会计制度、加强财务管理和预算执行分析等制度建设来规避，并提出一些具有实际操作的方法，为财务实践工作者提供一个参考范例。高等院校在实现人才培养的过程中，也表现出与企业生产产品类似的循环，因此在债务风险的分析和评价方面，本文提出了一种全新的评价方式，就是不改变现有高校收付实现制的会计核算前提、模式和框架，以企业财务报告为架构来重新设计和转换提供负债信息载体的高校财务报告，并以此为基础设计偿债能力六指标、财务警示指标、Z计分模型和巴萨利模型来分析和评价高校债务风险，最后以某高校2004-2006年度财务决算数据作案例分析，得到该高校三年定量债务风险指标。因此，通过设计新的高校财务报告和评价指标，高校潜在的、隐蔽的财务风险可以得到量化指标，并以此量化指标作为建立高校财务风险的预警机制，同时也希望本文能给高校会计实务工作者提供一个测算高校财务风险的方法或起到一定的参考价值。