煤炭作为我国的主要能源，在国民经济和社会发展中具有重要的战略地位。长期以来高强度、群体化、粗放式开发，形成了“多小散乱”的煤炭开发格局，带来了资源浪费、生态环境破坏、安全事故频发等一系列问题，经济社会可持续发展面临严峻挑战。为解决这一严峻问题，我国进行了煤炭资源的整合，这是近十年来我国煤炭资源管理领域实施的最为重要、规模最大、最为复杂的一次管理实践，煤炭资源整合管理已经成为当前我国资源管理领域的热点问题。本研究从复杂系统角度进行分析，认为煤炭资源整合是一个由社会、经济、资源、管理、技术等子系统构成的复杂系统。其组织结构的设置与功能的分配完全是有关决策部门的相关组织者主观信息的产物，煤炭资源整合组织管理系统是确保煤炭资源整合正常运行的组织保证。系统结构设置是否合理对煤炭资源整合的顺利进行具有至关重要的作用。研究煤炭资源整合组织管理系统的复杂性问题，对管理组织机制进行有益地探讨，具有重要的理论与实践意义。作为煤炭资源整合的领军旗舰，山西省率先进行了煤炭资源整合，并取得阶段性成果，其煤炭资源整合的过程和组织结构的管理及运行机制具有典型的示范意义。本文在有关信息熵评价组织结构复杂性研究的基础上，进行了复杂性信息熵评价模型方法上的改进，试图在方法上对组织结构复杂性评价问题进行一点新的改进与探讨。建立复杂性评价要素，引用信息论中的信息熵概念作为复杂性要素的度量尺度，利用改进的主成分分析法计算得出各资源整合组织管理系统各等级层的评价要素的信息熵值，将其作为元素构建层熵向量，进一步组成熵矩阵；利用改进的主成分分析法对各层的熵向量进行综合分析，将各个层熵向量的投影值作为该层的统一复杂性值，确定影响系统复杂性的主要等级层和因素，进而得出系统的整体复杂性评价值。论文以山西省煤炭资源整合、山西焦煤集团煤炭资源整合和整合煤矿—正丰煤业公司的组织管理系统为例，从宏观上决策层—省级组织领导结构、运行机制到中观执行层—整合主体煤矿企业集团，到微观操作层--整合煤矿的组织管理系统进行了复杂性评价，实证了上述方法的可操作性与合理性。最后依据所得计算结果，提出了提高组织管理效率、减少结构复杂性、促进煤炭资源有效整合管理的相应措施，在实践上试图对资源整合组织管理问题提供一些有益的决策参考。