随着经济的快速发展,环境问题已经变的日益突出,环境管理越来越成为政府管理工作的基本职责,这就要求必须建立与之相适应的科学的环境行政管理体系。当下,大部门制已经成为组织体制改革的重要路径选择,其旨在以构建科学的组织结构为载体,实现职能整合与部门整合的有机统一。新一轮的环境行政组织改革正是依照此改革理念来探索和推进的。但是,两年的改革过程和效果却显示改革的理念并没有在环境行政组织得到实质上的落实,因此,探索环境行政组织机构的优化设计对于进一步推动体制改革具有明显的意义。本文以环境行政组织结构为研究对象,探讨了我国环境行政组织结构的现状与特点,概括了大部门体制改革背景下我国环境行政组织改革状况,从中总结分析了现行组织结构在职权配置、机构设置、运行机制、管理方式以及组织主体建设等方面存在的亟待改革的不足之处。针对这些问题,借鉴国外相关改革经验,结合构建大部门体制的理论思考,提出了未来环境组织结构应继续立足于环境行政统一管理与分级、分部门相结合的基本框架,本着明确事权划分、解决职责交叉与优化组织设置和运行机制的基本原则,从横向和纵向维度对目前在部门职能结构、层级形态结构、权力运行机构以及协同合作结构等方面存在的不合理之处进行优化,依循区别统管部门与分管部门、中央与地方的职权责任,扩大管理幅度与减少管理层次,尝试构建决策权、执行权、监督权之间既相互制约又协调的运行结构,完善协调合作机制建设等路径,实现机构、职能、权力、责任、运行机制、管理方式等协调运作。同时,还应对组织主体建设、环境行政法治建设以及相关配套领域进行系统改革,从而全方位的对环境行政组织结构进行优化。