从华南地区七个红树林保护区采集红树林土壤的混合样品，运用三种添加抗生素的选择性培养基分离红树林环境可培养的小单孢菌，在三种样品预处理下，本研究得到类似小单孢菌株共127株。同时，实验提取了环境样品的总DNA，利用小单孢科的16S rDNA特异引物做为探针，进行PCR扩增。七个地区的扩增结果都是阳性，表明这七个地区都分布有小单孢科的菌株。 实验检测了分离菌株的抗肿瘤、抗耐甲养西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的活性，其中具有抗肿瘤活性的菌株数为17株，活性比率为13.4％；具有抗MRSA活性的菌株数为6株，活性比率为4.7％。 实验依据其在YE培养基上生长1周后的形态特征将127株菌分为13个组，从每组选出代表菌株进行初步鉴定，共选出18株。通过对这18株提取DNA进行16SrDNA的扩增并测序，得到其16S rDNA的核苷酸序列，利用多序列比对等工具对它们进行系统发育分析。菌株在系统发育树中被分成3个分支，分别归属于 Micromonospora,Actinoplanes,Verrucosispora三个属。 由分离结果分析比较，各个红树林环境都分布有小单孢菌科的菌株，但是由于各个地区的生理条件有差异，分离结果也表现地域差异性。在本实验的分离策略下，小单孢菌属在红树林Micromonosporaceae中是优势菌属。