进入到21世纪之后，我国城镇化的发展步伐越来越快，市场经济活跃度也越来越高，人口的流动性也越来越大。在这样的社会转型大背景之下，我国农村原有的大量劳动力大规模迁移到城镇，这些劳动力的工作形式也不再局限于原有的第一产业，而是延伸至第二产业和第三产业。农村人口的流失导致很多农村集体土地无人耕种，大量集体土地闲置，土地资源的利用效率较低，造成极大的资源浪费。针对上述长期存在的客观情况，我国从中央层面不断出台相关法律法规和农村产业扶持政策，旨在进一步激发农村土地活力，提高农民收入，提升农业生产的积极性。在多项举措中，农村土地的“三权分置”受到广泛的关注。“三权分置”的核心就在于进一步将农村土地经营权从土地承包权中分离，有助于土地经营权更好的在不同主体之间实现高效的流转，更好的发挥土地聚集规模效应，实现土地资源的优化配置。新近修订的《农村土地承包法》明确肯定了土地经营权的独立性，将土地经营权进一步分离具有重大的现实意义。但农村土地经营权在理论和实践中凸显的诸多问题仍未得到解决，农村土地经营权人的权益未能得到有效保障。本文从探究土地经营权的性质入手，通过运用文献分析法、逻辑分析法、比较分析法等研究方法重点阐释土地经营权的法律性质以及当前我国农村土地经营权人权益保护的法律困境，并结合相关法律法规提出完善建议。
　　本文对“三权分置”背景下土地经营权人权益保护研究共分为四个部分：
　　第一部分中，首先对“三权分置”背景下土地经营权的基本内涵及法律性质进行了介绍。“三权分置”的三权即土地所有权，土地承包权和土地经营权，围绕这三者之间的关系进行了厘定。
　　第二部分中，对“三权分置”下农村土地经营权人及经营权人享有的权利范围进行界定。目前我国农村土地经营权人包括传统和新型两种。另外，分析总结出保障农村土地经营权人权益对于当下社会发展的现实价值。对我国法律关于农村土地经营权的规定进行了梳理。最后，对土地经营权人所享有的权利进行了归纳，从法理角度看，农村土地经营权的权益内容包括土地所能带来的经营收益性权益，如占有权、使用权、收益权、改良土壤的权利、再流转的权利和以土地经营权融资担保的权利等。
　　第三部分从当前的立法规定和实践现状出发，总结出我国目前农村土地经营权人权益保护存在的问题包括几个方面，分别是：土地经营权等级制度、流转制度不规范，土地经营权人面临较高的违约风险，自主经营权易受侵犯以及征收补偿权被剥夺。并对这些问题存在的原因进行了分析。
　　第四部分，探索并总结出解决上述法律困境的对策。首先应当对农村土地经营权等级制度进行完善，确保等级制度对于土地经营权流转的保障作用。其次，应当进一步规范土地流转市场，加强制度宣传和政策指引。另外，探索土地经营权保险制度；最后，构建多元的土地经营权纠纷解决机制，主要包括：调解、纠纷前置解决程序以及健全的司法救济途径三个方面。