[研究背景及目的]鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma,NPC）是我国沿海和中部省份高发和高致死的恶性肿瘤,开发新的治疗手段,提高治疗水平具有重要意义。黄连提取物黄连素对包括鼻咽癌在内的多种实体瘤和血液系统肿瘤均具有良好的抑制作用,但是其在鼻咽癌中的作用和机制仍不充分,因此,本工作基于二代高通量测序技术,分析了黄连素作用于鼻咽癌细胞S18的总体转录组,研究了其对S18细胞自噬的调控作用和相应的生物学功能,进一步揭示了黄连素抑制鼻咽癌的分子机制。[方法]利用CCK8,平板克隆形成,Transwell迁移和侵袭实验分析了黄连素对S18细胞生长、增殖、迁移和侵袭能力的影响。利用二代高通量转录组测序技术,检测了黄连素处理对S18蛋白编码mRNA及长链非编码RNA表达谱的影响,并利用GO和信号通路富集等方法进行了相关分析。利用qPCR,Western blot,RNA干扰及自噬抑制剂处理等手段,检测了黄连素处理对自噬相关基因的表达和蛋白水平、自噬水平、自噬调控通路活性和自噬功能的调控作用。[结果]CCK8结果显示,黄连素处理后呈浓度依赖性抑制S18细胞的生长与活性。平板克隆形成结果表明,黄连素处理可以显著抑制S18细胞的克隆形成大小和数目。由Transwell迁移、侵袭实验可知,黄连素处理可以显著抑制S18细胞降解基质胶（Matrigel）,穿过多孔膜的细胞数目。黄连素处理差异基因显著富集于错误折叠蛋白内质网应激、DNA复制、细胞凋亡及炎症反应等GO过程,信号通路分析显示,差异基因显著富集于MAPK、Hippo、PI3K/AKT、TGFβ和p53等肿瘤致瘤和自噬调控信号通路。qPCR,Western blot等结果显示,黄连素处理显著上调ULK1,及MAP1LC3B等自噬相关基因的表达和蛋白水平,上调SQSTM1的表达水平,下调SQSTM1的蛋白水平,同时促进LC3B-II的累积。另外,黄连素可以显著抑制AKT/mTOR通路活性。敲低ATG5抑制自噬水平后,可以显著拮抗黄连素对S18的抑制效应。[结论]黄连素处理可以显著抑制S18细胞的生长、增殖、迁移和侵袭能力;可以改变S18细胞的表达模式,抑制AKT/mTOR等促瘤信号,诱导细胞发生自噬性死亡而抑制S18细胞的生长和恶性特征。