农业是我国国民经济的基础性产业,农业能否得到长足良好的发展事关我国国计民生。以现代化企业制度为特征的市场经济运作是在社会主义市场经济体制下发展我国现代化农业的重要手段。与一般企业相比,上市公司具有先进的治理结构,透明的财务制度以及优良的资产设备。因此,农业上市公司代表了我国现阶段最先进的农业生产力。大力推进与扶持我国农业上市公司的发展,不仅能够促进我国农业经营产业化,推进农业产业结构调整,而且能够提高农产品质量和农业经营效益,提升我国农业的国际竞争力,这对于加快实现农业现代化和全面发展农村小康社会具有十分重要的意义。本研究在对现有的公司绩效理论成果进行文献分析的基础上,构建了中国农业上市公司财务绩效评价指标体系,并采用DEA模型与Malmquist全要素生产率指数对中国农业上市公司财务绩效进行评价研究。首先,将DEA模型与Malmquist全要素生产率指数相结合,采用该方法对样本公司的财务绩效指标进行静态和动态评价分析。其次,为了进一步分析技术效率与规模效率对样本公司财务指标绩效综合效率的影响,运用Matlab语言编程对技术效率与综合效率以及规模效率与综合效率的关系进行拟合优度分析。最后,基于对中国农业上市公司财务绩效评价结果分析,提出了改进中国农业上市公司财务绩效的对策。