本文以浙江种源马尾松1139×广西种源马尾松5916的F1杂交群体为作图群体,主要利用SSR、ESTP和SRAP三种分子标记初步构建马尾松遗传图谱。对松科其他树种中开发的298对SSR引物和96对ESTP引物进行了筛选。分别有152对SSR和40对ESTP引物有产物,比例为51%和41.6%;分别有18对和7对引物有多态,多态性比例为6%和7.3%,分别产生36个和7个多态位点。312个SRAP引物组合中,56个组合能够扩增出清晰且有多态的条带,共产生215个多态性位点,平均每个引物组合产生3.83个位点。通过群体检测,挑选出262个扩增谱带清晰稳定的多态性标记,用于遗传连锁图谱的初步构建:获得了含有20个连锁群,共87个标记的连锁图谱,其中有9个SSR标记,77个SRAP标记,1个ESTP标记。图谱中拥有4个及4个以上的标记的连锁群有6个,三联体2个,二联体12个,平均每个连锁群4.35个标记;最大连锁群图距为165.1cM,最小连锁群图距为24.1cM,总图距长度为1490.8cM;标记间最大间距为48cM,最小间距为2cM,标记间平均间距为16.2cM。图谱中有2个eSSR标记在火炬松(P.taeda L.)与湿地松(P.elliottii Engelm.)有同源位点且存在着连锁关系,而在马尾松中LOD值为3.0时不在相同连锁群。当降低LOD值为2时,两个标记在马尾松中也会位于相同的连锁群,且两个标记的距离与火炬松相似。