Foot-and-mouth disease virus(FMDV)是一种高度传染性的正链RNA病毒,严重威胁畜牧业的发展,而持续感染使得这一情况更加糟糕。目前FMDV持续感染的机制仍不清楚。大多对RNA 病毒感染的原代细胞培养物或建立的纽胞系研究表明,持续感染的机制涉及病毒、细胞或两者的遗传变异。而对于裂解性病毒,其中限制细胞死亡的一种方法是通过产生并积累有复制缺陷性病毒突变体或是通过选择非细胞裂解的病毒突变体以竞争抑制正常病毒的感染,另一种方法则是选择对病毒感染有限制允许性的宿主细胞达到限制细胞疾病的目的。然而,目前涉及FMDV持续感染的机制仍不清楚。利用先前建立的O型FDMV持续感染BHK-21细胞系,我们发现,在FMDV持续感染细胞系中存在大量FMDV阴性细胞(Vrius eliminated cell,BHK_VEC),这些细胞表现出对亲本FMDV及FMDV-Op(持续感染细胞系的病毒上清液)的抗性,并且当用FMDV-Op感染BHK_VEC时持续感染被重新建立,暗示宿主细胞发生了进化;同时,病毒进化为更适应持续感染的环境,能有效感染BHK_VEC,而对BHK-21同样具裂解性感染;揭示出FMDV持续感染的建立并不是由于产生复制缺陷型以及非细胞裂解的病毒突变体导致的,而是分裂出进化的对病毒感染有限制允许性的宿主细胞而达到限制病毒的增殖。而进一步实验表明,进化的细胞对FMDV感染的限制发生在病毒RNA复制过程,使得病毒增殖过程无法有效进行。利用下一代转录组测序,我们发现,与正常细胞相比,4686个基因在BHK_VEC中差异表达。进一步的功能分析表明这些差异基因参与细胞代谢,细胞分裂,细胞周期,细胞蛋白质分解代谢过程和结合过程等过程;同时,1229个选择性剪接事件在BHK_VEC中被显著诱导,特别是外显子跳跃(SE)事件,这些可变剪接变化基因显著富集于细胞成分,细胞代谢过程,转录调控,蛋白质修饰过程和染色质修饰以及氨基糖和核苷酸糖代谢及赖氨酸降解通路。此外,BHK_VEC具有比BHK-21更强的免疫应答和更弱的MAPK信号响应。同时,我们发现,在BHK_VEC中MAPK信号通路相关基因相比于亲本BHK-21显著下调。而相比于BHK_VEC,在BHK-Op中MAPK信号通路相关基因显示上调,暗示MAPK信号通路参与持续性病毒感染复制过程的可能性。用U0126将MAPK/ERK通路进行特异性抑制后,FDMV的增殖显著受损,并表现出形成持续感染的趋势,暗示MAPK/ERK信号通路参与FMDV持续感染建立的可能性。我们的研究探讨了 FMDV持续感染建立的机制。同时,这些全面的转录组数据不仅促进了筛选抗FMDV感染的相关基因,而且为探索FMDV持续感染的精确机制提供了有用的信息。