茶尺蠖小RNA病毒非结构蛋白2C的功能研究

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茶尺蠖小RNA病毒是我国首次分离得到的一株昆虫小RNA病毒,属于传染性软化病病毒科。至目前为止,该病毒的非结构蛋白3C(切割酶),3D(聚合酶)已经有比较详细的研究,但是对于2C蛋白,一个预测为解旋酶的蛋白(2C)还没有被研究,本论文对该蛋白进行了功能研究。首先对2C蛋白进行了原核表达,结果没有得到可溶性的蛋白。复性后的蛋白也没有检测到NTPase活性和解旋活性。考虑到影响蛋白活性的因素可能是可溶性和缺乏某些修饰作用,于是选择在2C蛋白的N端加入MBP标签并利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在真核细胞sf9中对蛋白进行表达。加入MBP标签后的蛋白可溶性增加,经过纯化得到了较纯且可溶的MBP-2C蛋白,利用该蛋白我们进行了NTPase活性和解旋活性的研究。在研究中发现,MBP-2C蛋白具有NTPase活性。能够水解四种不同的NTP和四种不同的dNTP;在不同二价金属阳离子参与的ATP酶活性反应中都具有ATPase活性,但活性有很大差别;另外研究了不同因素(pH值,NaCl浓度,Mg2+浓度)对MBP-2C蛋白ATPase活性的影响,结果显示在pH8, NaCl浓度25mM, Mg2+浓度2.5mM的时候该蛋白具有最高的ATPase活性。MBP-2C蛋白具有解旋活性。对解旋双链没有特异性,能够解旋两端具有单链突出的RNA双链,DNA双链以及RNA-DNA杂合链。在解旋的方向上具有两极性,能够解旋只具有3’端单链突出的双链也能够解旋只有5’端单链突出的双链,但是不能够解旋平末端的双链,说明具有单链突出的双链对于解旋反应是必需的。另外研究发现,Zn2+对解旋反应的抑制作用非常灵敏,在2mM的时候能够完全抑制解旋活性。高浓度的Mg2+也能抑制解旋活性,但是Mg2+的抑制作用对解旋反应来说是不灵敏的,在浓度为15mM的时候,仍然有大量的双链能够被解旋。对MBP-2C蛋白的突变体进行研究的结果也证明了该蛋白的ATPase活性与解旋活性是两个相对独立的过程,因为ATPase活性降低了一半的突变体蛋白其解旋活性与野生型蛋白的解旋活性相差很小,而ATPase活性并没有降低的突变体蛋白H1562其解旋活性却显著降低。在研究解旋反应的影响因素过程中发现,MBP-2C蛋白的解旋反应并不需要NTP的参与,也不需要Mg2+的参与。这是两个与经典解旋酶相比非常不同的性质。根据解旋酶的定义,它的解旋足NTP依赖的,于是我们针对该蛋白进行了核酸分子伴侣的相关实验,结果表明该蛋白能够促进互补双链的退火。再加上之前的解旋活性,我们认为2C蛋白是一种RNA分子伴侣这是小RNA病毒目中功能首次被研究清楚的2C蛋白。
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