hsa-miR-378的生物信息学特征及其在人脂肪细胞中的表达调控规律

来源 :南通大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:gao_zhenguo
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目的本研究主要探讨:1、脂肪细胞分化相关micro-RNA-hsa-miR-378的预期生物学功能,包括转录调控、靶基因功能;2、miR-378在脂肪细胞分化前后的表达变化。3, TNF-α、IL-6、leptin、resistin分别对人脂肪细胞中miR-378表达的影响。方法1、应用UCSC Genome Browser Promoter scan等在线工具,分析hsa-miR-378在基因组上下游10kb以内的CpG岛分布情况、转录起始位置(TSS)、转录因子结合位置(TFBS)等;选择TargetScan、PicTar、MiRanda三种计算方法预测hsa-miR-378的靶基因,取三个预测结果的交集,并合并DIANA LAB-TarBase6.0数据库的已验证靶标,对所得靶基因集分别进行GO注释描述、GO富集分析和pathway富集分析。2、利用Real-time PCR技术,检测脂肪细胞分化前后miR-378的表达水平,及TNF-α、IL-6等干预前后miR-378的表达水平。结果1、生物信息学分析显示:hsa-miR-378可能具有独立的启动子,可能受C/EBP β转录因子的调控;其预测靶基因集合富集于转录调控、蛋白质修饰、细胞分化等生物学过程和功能(P<0.01);并显著富集于TGF-β信号通路、Wm信号通路等4个信号通路,以及甲状腺癌、系统性红斑狼疮等8个疾病通路中p<0.05)。2、分化成熟的人脂肪细胞中miR-378的表达量较分化前显著上调(P<0.05)。3、TNF-α、IL-6及leptin显著上调人成熟脂肪细胞中miR-378的表达(P<0.05),但resistin对其表达量无影响(P>0.05)。结论hsa-miR-378与人脂肪细胞的分化成熟过程密切相关;m1K-3/8可能生肥胖及其并发症的发生发展中起重要作用,并为肥胖的早期干预及肥胖相关并发症的防治提供新的靶点。
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