葛藤属(Pueraria spp.)根瘤菌的分类地位和多样性初步研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:arksh
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本研究以从我国四川、河南、安徽和湖南等地分离的32株葛藤根瘤菌为研究对象,以20株已知种的根瘤菌为参比菌株,采用数值分类、REP-PCR指纹分析、16SrDNA PCR-RFLP指纹分析等现代根瘤菌分类技术,初步研究了葛藤根瘤菌的生物多样性和分类地位,结果表明: 葛藤根瘤菌在生长速率上表现出多样性,菌株CCBAU41147、CCBAU61096、CCBAU61101和CCBAU61095生长较快,YMA培养基上28℃培养2-3天后,单个菌落直径大于1mm,具有产酸能力,是快生型葛藤根瘤菌;其余待测葛藤根瘤菌生长较慢,YMA培养基上28℃培养7天后,单个菌落直径小于1mm,具有产碱能力,是慢生型葛藤根瘤菌。数值分类对所有供试菌株进行了131项表型性状的测定,结果表明,葛藤根瘤菌具有丰富的表型多样性,表现在利用多种化合物作为唯一碳源、氮源能力,对抗生素、染料和化学药物的抗性,耐酸性,产酸产碱情况,硝酸还原能力等方面。在80%的相似性水平上,供试葛藤根瘤菌分成10个表观群,表现出种水平的多样性,尤其是慢生葛藤根瘤菌分为7个表观群,表型多样性极为丰富。以Boxair为引物的REP-PCR分析结果表明葛藤根瘤菌存在不同水平的遗传多样性,在81%的相似性水平上,供试葛藤根瘤菌分成了11个遗传群,其结果证明了慢生葛藤根瘤菌的遗传多样性。在数值分类的基础上,挑选各表观群菌株(包括中心菌株)21株(12株待测菌株和9株参比菌株)进行16S rDNA PCR-RFLP指纹分析,12株待测葛藤根瘤菌产生了9种限制性内切酶酶切图谱类型,慢生型菌株的图谱类型明显不同于快生、中慢生菌株的图谱类型。一些菌株如CCBAU61116、CCBAU41069、CCBAU23168等具有专一的酶切图谱类型。16S rDNA PCR-RFLP聚类分析结果在90%的相似性水平上把慢生型根瘤菌分成7群,也证明了葛藤根瘤菌种水平的多样性。 在数值分类中,表观群1的葛藤根瘤菌与B.elkanii的模式菌株(USDA76~T)聚在一起,群内相似性为80%,初步判定群1供试葛藤根瘤菌为且Belkanii。表观群5与B.japonicum的参比菌株聚在一起,群内相似性为83%,初步判定这群葛藤根瘤菌为B.japonicum。而其它群未与已知分类地位的供试参比菌株聚在一起,其确切分类地位有待进一步研究。在REP-PCR指纹分析中,遗传群1由B.elkanii的参比菌株和9株待测葛藤根瘤菌组成,遗传群3由3株B.japonicum的参比菌株和2株待测葛藤根瘤菌组成,遗传群7由4株待测葛藤根瘤菌和3株B.yuanmingense的参比菌株组成。而其它遗传群未与已知分类地位的供试参比菌株聚在一起,它们是不是新的遗传群,值 得进一步研究。16s rDNA PCR-RFLP分析结果也表明葛藤根瘤菌具有种水平多样性, 在 90%的相似性水平上,聚类图把慢生根瘤菌分成 7群,群 1与 BJponicum的模式 菌株聚在一起,群二与 B elhanii的模式菌株聚在一起,而其它群是独立的系统发育分 支。 数值分类、yPFCR分析、16s n3NA PCR-RFLP分析对慢生葛藤根瘤菌的分群 存在较大差异,说明葛藤根瘤菌内丰富的多样性和分类地位的复杂性,要确定其确切 分类地位和系统发育关系,要通过 G+C mol%含量测定、DNA.DNA杂交、16s n>NA 全序列测定来确定。
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