石蒜属(Lycoris Herb)是石蒜科(Amaryllidaceae)多年生草本植物,该属约20个种,主要分布于东亚的中国、日本和韩国,印度及尼泊尔有零星分布。我国有15种和1个变种,其中10种是我国所特有的,我国长江以南地区是该属植物的多样化和多度中心。由于自然条件石蒜属植物可以进行广泛的杂交,故属内存在相当数量的自然杂交种,其他分类研究方法很难鉴定石蒜属的分类。叶绿体DNA为单亲遗传,在鉴定植物网状进化方面有重要作用。因此本实验在前期研究基础上,采用叶绿体DNA序列研究石蒜属种间亲缘关系及杂交起源问题。在种水平上,本研究选取了石蒜属的16个种,4个变种和和2个人工杂种；在居群水平上,这些种及变种包括了我国、韩国和日本东亚分布的29个居群,通过对这些材料叶绿体trnC-ycf6和trnS-trnfM序列的分析,较好的揭示了石蒜属的种间亲缘关系,尤其是自然杂交种的起源问题：(1)基于叶绿体DNA序列分析结果,在种水平上,石蒜属材料可分为三支：具有M(中部着丝粒)和T(端部着丝粒)染色体的种聚在同一个分支内(Ⅰ)；具有ST(近端部着丝粒)染色体种组成另外两支(Ⅱ,Ⅲ),具有M、ST和T染色体组型的种(“杂交种”,包括两个人工杂交种)分散在三个分支内。(2)结合前期的ITS(核基因组)分析结果和两个遗传背景清楚的人工杂交种,本研究证实了具有M、ST和T染色体组型的“杂交种”为杂交起源。本研究采用单亲遗传的叶绿体DNA序列较好的揭示了石蒜属种间系统发育关系和多倍体类群的杂交起源,为石蒜属植物的系统进化和物种形成研究奠定了初步的科学基础。