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干扰素(Interferon，IFN)系统在鱼类非特异性免疫中发挥重要作用。本实验室已成功建立研究鱼类IFN系统基因的细胞模型系统，并分离和鉴定了一系列病毒诱导基因。本研究在此基础上，克隆鉴定了IFN系统基因NEDD8 UltimateBuster-1(NUB1)并对其诱导表达特性进行了分析，同时对另外两个IFN系统基因Interferon regulator factor3(IRF3)和Interferon regulator factor7(IRF7)的亚细胞定位进行了研究。
NUB1是近年来发现的一种干扰素诱导表达基因，哺乳类的研究表明，过量表达该基因能抑制细胞生长。本实验通过RACE-PCR方法从产生干扰素的鲫囊胚培养细胞(Carassius auratus blastulae embryonic cells，CAB)中克隆出鲫NUB1基因。鲫NUB1全长eDNA为2298bp，编码一个由589个氨基酸残基组成的蛋白。推导的鲫NUB1蛋白具有哺乳类同源蛋白保守的结构域，包括N端的UBL结构域(Ubiquitin like domain)和C端两个UBA结构域(Ubiquitin associated domain)，与已知的哺乳类包括人和小鼠、鸟类和两栖类的同源蛋白具有41-45％的相似性。诱导表达分析显示：Poly I∶C和LPS均能诱导CAB细胞NUB1 mRNA的上调，表明NUB1基因在鱼类的抗病免疫反应中发挥某种重要作用。
IRF3和IRF7是哺乳类干扰素抗病毒信号通路中两个关键的调节因子，能够调控typeⅠ IFN和IFN刺激基因(Interferon stimulated genes，ISGs)的表达。本实验首先利用同源克隆法克隆了鲫IRF3基因，其全长cDNA为1839bp，编码一个由458个氨基酸组成的蛋白。推导的鲫IRF3蛋白具有哺乳类同源蛋白保守的结构域，N端DBD结构域(DNA binding domain)包含5个保守的色氨酸(Trp)重复序列。C端与其它物种的同源性较低，但也具有IAD结构域(IRF associationdomain)的核心序列。C端富含丝氨酸(Ser)残基，推测是磷酸化位点。其中DBD结构域的70-92氨基酸序列是一段富含K/R的序列(70NGDHSVWKRNFRSALRAKGFKM92)，推测是一个核定位信号(nuclearlocalization signal，NLS)。软件推测I327可能与核输出信号(nuclear export signal，NES)相关。将IRF3与IRF7的ORF与GFP相连构建表达载体，转染COS7细胞，发现IRF3和IRF7主要定位在细胞质，转染5h加入100-300gg/ml polyI∶C诱导，19h后观察，IRF3和IRF7蛋白主要定位在细胞质，但均有少量定位在细胞核内。