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为了科学的评价、保护和利用中国特有鹿种资源,本试验利用微卫星DNA标记技术,从鹿的近缘物种——牛的微卫星位点中筛选20对引物,对西北4个中国特有鹿种,即甘肃马鹿、阿拉善马鹿、青海马鹿、白唇鹿,以及对照鹿种——东北梅花鹿共152份样本的遗传多样性进行分析研究,结论如下:1. 20对引物中,14对引物有扩增产物。共检测到111个等位基因,其中包括27个特有等位基因。在哈-温平衡检验中,甘肃马鹿、阿拉善马鹿、青海马鹿、白唇鹿中分别有2个、5个、1个、2个位点符合哈-温平衡,而梅花鹿所有位点均不符合哈-温平衡。中性检验分析中,有9个位点属于中性位点。2.甘肃马鹿、阿拉善马鹿、青海马鹿、白唇鹿和梅花鹿群体的多态信息含量(PIC)分别为0.523、0.365、0.554、0.320、0.390,期望杂合度分别(He)为0.580、0.446、0.614、0.397、0.501,Shannon信息指数(I)分别为1.109、0.819、1.176、0.694、0.966;有效等位基因数(Ne)分别为2.884、2.251、3.066、1.967、2.523。3. 3个马鹿群体的遗传分化系数(Gst)为0.163,83.7%的遗传变异是由群体内遗传多态现象引起,16.3%来自群体间的差异;群体间配对固定指数(Fst)分析结果是其均处于中度分化状态,其中甘肃马鹿与青海马鹿的分化程度最低。在5个鹿群体固定指数分析中,Fis、Fit均为正值,说明群体内都存在不同程度的近交现象。4. 3个马鹿群体的基因流(Nm)均大于1,甘肃马鹿和青海马鹿的基因流最大,为2.301。5个鹿群体的基因流(Nm)总体比较,3个马鹿群体与白唇鹿、梅花鹿的基因流(Nm)均小于1。5.在3个马鹿群体的Nei’s遗传距离(Da)分析中,甘肃马鹿与青海马鹿的遗传距离最小,青海马鹿与阿拉善马鹿的遗传距离最大;5个鹿群体的Nei’s遗传距离(Da)则表现为,马鹿与白唇鹿的遗传距离最小,与梅花鹿的遗传距离最大。在遗传聚类分析中,甘肃马鹿与青海马鹿首先聚为一类,再与阿拉善马鹿聚合成为第一集团;马鹿集团与白唇鹿聚合后,再与梅花鹿聚合。