小麦三雌蕊性状的基因定位及连锁标记开发

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小麦(Tritium aestivum L,2n=6x=42,AABBDD)是我国三大粮食作物之一,全国40%以上的人口以小麦作为主食。小麦的安全生产与产量提高,对促进我国粮食安全和保障市场需求具有重要影响。小麦穗粒数是影响小麦产量的三大要素之一,小麦穗粒数一直以来都是遗传育种学家研究的焦点。CH257是“三粒小麦”与普通小麦石优20回交三次后选育的一个三雌蕊材料。本研究对CH257的三雌蕊性状进行了遗传分析,使用90K SNP基因芯片对小麦三雌蕊性状基因进行初步定位,在初步定位区间开发SSR标记进行精细定位,结果如下:1、研究材料以CH257为三雌蕊亲本、中国春(CS)为单雌蕊亲本,构建F2分离群体、BC1群体。F1、BC1、F2及其单、三双亲在花期进行表型鉴定。群体内遗传分析结果表明,小麦CH257的三雌蕊性状由一对显性核基因控制,暂命名为Pis-CH257。2、使用90K SNP基因芯片分别对CH257/中国春(CS)组合两个极端混池以及双亲进行全基因组检测,SNP差异位点在2D染色体上分布达247个,约占总SNP数量的44%,故小麦三雌蕊性状基因为与小麦2D染色体的长臂端。3、选取已发布中国春2D染色体570-620.3 Mb区段的基因序列,在此区段内开发与小麦三雌蕊性状基因相关的SSR标记,最终筛选到5个标记与Pis-CH257存在连锁关系,其顺序为2DL07、2DL17、2DL22、Pis-CH257、2DL25、2DL38,Pis-CH257两侧的连锁标记2DL22、2DL25与其遗传距离分别为1.1 c M和2.5 c M,物理距离为2D染色体592.3-595.4 Mb。4、雌蕊基因Pis-CH257被定位在标记2DL22和2DL25之间3.6 c M的遗传区间。对该区间内的基因进行功能注释,结果在该区间内共筛选出44个潜在蛋白质基因编码。其中包含可能与花发育相关的基因,如CRAL-TRIO脂质结合域超家族、CLE-related和F-box家族等。
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