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本试验选用SLA复合体区域17个微卫星位点,探究了猪地方群体遗传多态性,包括莱芜猪、蓝塘猪、小梅山猪、宁乡猪、淮南猪、圩猪和陆川猪7个品种；并筛选了12对微卫星引物对杜洛克×二花脸F2资源群体进行了多态性检测,且与80天血液免疫指标做的关联分析,通过计算等位基因数、遗传杂合度和多态信息含量等指标来衡量群体内SLA的遗传多态性,并运用遗传的距离和群体的结构等分析了群体间的遗传变异,利用R语言GLM模型与免疫指标做了关联分析,结果如下：1.共检测了7个地方猪品种SLA复合体内17个微卫星座位一共228个个体的遗传多样性。在总体群中总计检测到了73个等位基因,7个地方品种所有座位平均10.18个等位基因,7个地方品种每个座位平均4.82个。2.发现了莱芜猪中SLAMS034、SLAMS045和SLAMS056三个座位多态性较低,小梅山猪中SLAMS016、SLAMS034和SLAMS035多态性较低,宁乡猪中SLAMS056多态性较低,淮南猪中SLAMS052和SLAMS098两个座位多态性较低以及圩猪中SLAMS056多态性较低,其余座位均表现较好的多态性。从7个群体水平总体来看,观测杂合度(Ho)在0.125(SLAMS034)～0.906(SLAMS013)之间,期望杂合度(He)在0.173(SLAMS059)～0.875(SLAMS018)之间,多态信息含量(PIC)处于0.155(SLAMS059)～0.854(SLAMS018)之间。小梅山中SLAMS013和SLAMS098均纯合。5个群体的中、低度多态微卫星分别为SLAMS045、SLAMS056和SLAMS098(蓝塘猪除外)；高度多态座位分别为SLAMS005、SLAMS013(小梅山除外)、SLAMS018、SLAMS043和SLAMS052。3.F-统计结果可知,7个地方猪群体之间遗传分化还是比较大的,群体间引起的遗传变异占22.9%,而各群体内个体间的差异引起的遗传变异则是77.1%。运用基于遗传距离的聚类分析与群体遗传结构指标分析了7个地方猪品种的遗传结构,两方面得出的结论趋于一致。两种不同的分析方法都将7个地方猪品种按以下划分：圩猪与陆川猪首先聚为一类,其次可与淮南、宁乡猪聚为一类；莱芜与蓝塘猪聚为一类,小梅山猪聚为另一类。4.在杜洛克×二花脸杂交F2资源群体中检测了12个微卫星座位的等位基因,计算了各座位的等位基因数和等位基因频率,获得了其各位点的杂合度,多态信息含量,发现它们在此资源群体内具有较为丰富的多态性；另外,将SLA Ⅰ、Ⅱ经典基因附近多态信息较好的位点在资源群体与地方猪群体间作了对比,在SLA Ⅰ类区域,地方猪的PIC较高(0.537),杂交品种为(0.496)；但在SLA Ⅱ区,杂交品种的较高0.62,地方猪为0.53。5.分析SLA微卫星座位与杜洛克x二花脸杂交F2资源群体猪(392头)与80天血液免疫指标的关系。结果表明,所选择12个微卫星座位中,SLAMS035与80D_blood_parameter (80D)-BA显著相关(P为0.040),SLAMS034与80D-BA%显著相关(P为0.026),SLAMS050与80D-PDW显著相关(P为0.045),SLAMS013与80D-MPV、80D-NE%显著相关(P分别为0.025,0.037)及与80D-PLT极显著相关(P为0.006),SLAMS056与80D-BA%、80D-HCT、80D-HGB显著相关(P分别为0.022,0.011,0.027),SLAMS048与80D-LY%.80D-MCV显著相关(P分别为0.024,0.032)且与80D-MHC、80D-WBC极显著相关(P分别为0.003,0.006),另外,SLAMS016与80D-NE%显著相关(P为0.031)。