由链格孢菌（Alternaria alternata）引起的烟草赤星病是烟草生产中危害及其严重的叶斑类病害。病原菌可以通过分生孢子快速传播,在短时间内大规模爆发,赤星病的发病和烟叶成熟衰老程度高度相关,随着烟叶成熟,烟叶的抗病性也随之下降,赤星病一旦爆发就会给烟叶生产带来巨大损失。因此,及时预防是控制烟草赤星病的有效方法。目前,生产上采取的防治措施主要为化学防治,但由于化学防治的一些弊端,利用生物菌剂防治烟草赤星病害越来越成为生产上的迫切需求。为了丰富防治烟草赤星病的生防菌菌种资源,有效利用生物防治及化学防治相结合的方法控制烟草赤星病,本研究在烟草赤星病发病较轻地块选取健康植株的根际土壤40份,筛选获得了一株芽孢杆菌LZ88,该菌株对烟草赤星病菌具有明显的拮抗作用,同时对该菌株进行鉴定,并就其对烟草赤星病菌的拮抗作用进行初步研究,主要研究如下:1.通过平板稀释法及平板划线分离法从土壤中分离、纯化得到224株细菌菌株。通过平板对峙法筛选出一株对烟草赤星病菌（A.alternata）有明显抑制作用的菌株LZ88。该菌不仅对烟草赤星病菌（A.alternata）有抑制作用,还可以抑制烟草黑胫病菌（Phytophthora parasitica var.nicotianae）、棒孢霉菌（Corynespora Güssow）、葡萄炭疽病菌（Colletotrichum gloeosporioides）等病原菌的生长。2.通过形态特征、生理生化特性观察及16S r DNA和gyr B基因序列分析,通过构建系统发育树,结果显示菌株LZ88与暹罗芽孢杆菌聚在同一分支上,序列相似性分别达到99.72%和99.91%,最终确定菌株LZ88为暹罗芽孢杆菌（Bacillus siamensis）。3.菌株LZ88可以产生挥发性物质,该物质可以有效抑制烟草赤星病菌菌丝生长和孢子的产生。其无菌发酵滤液也可以有效抑制烟草赤星病菌菌丝的生长,同时破坏菌丝结构,影响孢子产生。菌株LZ88的发酵粗提液的抗菌物质可以抑制烟草赤星病菌,且比较抗高温、酸碱度等,具有良好的稳定性。4.菌株LZ88可以显著提高烟草植株的系统抗性,主要是通过提高烟草叶片中抗性相关酶的活性;5.拮抗菌LZ88发酵液可以有效防治烟草赤星病。温室试验表明,发酵液处理后的烟草几乎没有发病,而对照烟草发病较严重。预防试验防治效果达到78.64%,治疗试验中防治效果达到66.15%,说明该菌具有开发成生防菌株的潜力。6.建立了链格孢菌的荧光定量PCR检测体系,可以定量检测烟草叶片中链格孢菌的含量,用于指导病害防治时期与实际生产。