【摘 要】
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Ryanodine受体（ryanodine receptor,Ry R）是一种位于肌浆与内质网膜,在心肌和骨骼肌的兴奋收缩偶联过程中负责从细胞内存储释放Ca2+的通道蛋白。Ca2+作为生物体重要的离子,对生物体的新陈代谢有着至关重要的作用,除了在神经调节和肌肉系统的兴奋传导的作用以外还参与受精过程,胚胎发育,细胞分裂细胞分化以及细胞凋亡等重要的生命活动中具有重要作用。刀鲚作为具有经济价值的洄游性鱼
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Ryanodine受体（ryanodine receptor,Ry R）是一种位于肌浆与内质网膜,在心肌和骨骼肌的兴奋收缩偶联过程中负责从细胞内存储释放Ca2+的通道蛋白。Ca2+作为生物体重要的离子,对生物体的新陈代谢有着至关重要的作用,除了在神经调节和肌肉系统的兴奋传导的作用以外还参与受精过程,胚胎发育,细胞分裂细胞分化以及细胞凋亡等重要的生命活动中具有重要作用。刀鲚作为具有经济价值的洄游性鱼类,其基因组信息已公布,对于刀鲚Ry R基因家族的鉴定的研究分析尚未报道。适应盐度和渗透压的变化是能够成功洄游的必要条件,而Ca2+信号通道对渗透压的调节有着重要的作用,同时Ry R蛋白作为Ca2+的通道蛋白之一,其对刀鲚Ry R基因家族和Ry R基因在不同组织的表达的研究意义非凡。本研究首先以刀鲚的基因组数据为研究材料,利用生物学信息对刀鲚Ry R基因家族进行鉴定,分析刀鲚Ry R蛋白的理化性质、系统发育、基因结构、染色体位置等进行分析,通过运用三代测序技术得到刀鲚全长转录组结合刀鲚的基因组数据进行初步的分析研究,我们采用q PCR技术对Ry R基因的三个亚型在鳃、脑、卵巢和精巢的表达模式进行分析,更加丰富Ry R基因在生物体的表达方式的研究。主要研究结果如下:1、根据刀鲚基因组数据和斑马鱼等物种的Ry R基因家族序列,对刀鲚Ry R基因家族在刀鲚基因组中进行查找,在刀鲚全基因组数据库中鉴定到8个Ry R基因,它们随机分布在刀鲚的7个染色体上,1号染色体上有2个Ry R基因,完整的Ry R基因所编码的氨基酸数量在5000个左右,分子量大小在550KD左右,等电点（PI）值在5.03到5.75之间。刀鲚的8个Ry R基因有3个属于是Ry R1亚型,3个属于Ry R2亚型,2个属于Ry R3亚型。2、刀鲚的全长转录本共得到64.18Gb的clean data,得到环状一致性序列（CCS）739,989条,全长非嵌合序列（FLNC）590,087条,对FLNC聚类后得到168,407个一致序列,进而得到高质量一致性序列165,413个,去冗余后得到80,620个转录本。经过评估非冗余的转录本完整性,有完全匹配的序列有2,101条。对新发现的转录本进行序列结构分析,预测出267,282个SSR,92,178个完整的ORF序列以及1,418个Lnc RNA,共预测出1,393个Lnc RNA靶基因;可剪接事件29,299个;完成109,922个新转录本的功能注释;预测到7,421个转录因子,主要属于20个基因家族,其属zf-C2H2、ZBTB、Homebox、b HLH等的基因家族最多。全长转录组数据发现从基因层面得到8个Ry R基因,与鉴定出来的数量一致;从转录本的层面发现12个Ry R基因,包含了基因组鉴定到的8个,还有4个Ry R基因。3、刀鲚Ry R基因在脑、鳃、卵巢以及精巢组织中的差异表达。通过q PCR的方法对Ry R1、Ry R2、Ry R3在刀鲚的鳃、脑、卵巢、精巢组织中的表达情况。结果显示,Ry R1在鳃和脑中均有表达,在卵巢和精巢中基本不表达;Ry R2在海水组的鳃组织中表达量低于淡水组,在海水组的脑组织中表达量高于淡水组,而卵巢和精巢组织表达量在海水组和淡水组中并未表现出差异性;Ry R3基因在海水组鳃、脑、卵巢组织的表达量高于淡水组,且鳃组织中表现出极显著差异性（P＜0.01）,在脑和卵巢组织中表现出显著差异（P＜0.05）。
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