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随着我国制药工业的快速发展，制药废水的污染与治理己引起人们的高度关注。由于药物生产过程中不同药物品种有着不同的生产工艺、产品更换周期短，其制药废水中往往含有种类繁多的有机污染物，水质和水量存在着较大的差异，产品一旦更换，其废水水质、水量经常变动，极不稳定，其中含有不少难于降解或对微生物有抑制作用的污染物，增加了水处理的难度。另外，在制药生产的不断扩大中，很多原有的污水处理设施己不能满足日益增长的废水量，如何在有效控制经济成本的基础上又提高处理效果是目前比较关注的重点。本文从重庆某制药废水中筛选出四株高效降解微生物W1、W5、W7、W10、。通过对菌株的形态观察以及16S rDNA鉴定，四种菌株分别属于Aeromonas sp.、Rhodococcus sp.、Pseudomonas sp.、Bacillus subtilis.四个属。把W1、W5、W7、W10和实验室混合菌株CQS进行复配并确定其投配比，结果显示五种混合菌种按1：1：1：1：1的组合搭配降解效果最好，COD、NH3-N的降解率为83%，67%。运用正交试验对复合菌剂生长特性进行研究，结果表明：因素的主次顺序为：初始pH、接种量、摇床转速。即初始pH值对混合菌液生长影响最大，接种量次之，摇床转速影响最小。且可对每个因素选出最优水平，对于初始pH值，A2（pH=7）最好；接种量B2（20%）最好；摇床转速C3（r/min=100）最好，即最优组合为A2（pH=7）、B2（20%）、C3（100r/min）。运用高效复合菌剂对重庆某合成制药厂的污水处理场，进行生物相的恢复工程。结果表明：出水COD为100mg/L以下；出水氨氮浓度在1mg/L以下；出水色度在50以下；SS也在50以下。同时对生物相的镜检观察和采用PCR-TGGE技术对好氧池生物强化前后污泥中的生物多样性进行对比研究发现，采用生物强化以后好养池中污泥生物多样性明显增加。可见，生物强化技术处理制药废水，工艺运行稳定，对高浓度化学合成类制药废水有较好的处理效果，出水水质可达到《化学合成类制药工业水污染物排放标准》（GB21904-2008）的排放要求。以上研究结果表明，将筛选的复合菌剂应用于合成制药废水的强化处理是可行的。它简化了对处理工艺的改变，提高了处理效果，而且成本较低，为生物强化法处理高浓度难降解有机废水提供了理论基础和实际参考。