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玉米是我国第一大粮食作物,也是重要的工业原料和能源作物。随着农业种植模式和耕作制度的调整,生产上对脱水快且收获时含水量低的宜机收品种需求日趋迫切。但在实际生产中,玉米收获时含水量过高,仍然是玉米育种亟待解决难题。为给创制脱水快、含水量低的优良玉米种质提供理论参考,本研究以“十三五”四川省玉米育种攻关项目组10家单位提供的290份玉米自交系为试验材料,利用简化基因组测序(genotyping by sequencing,GBS)分析自交系群体的亲缘关系、群体结构等,并结合一年两点的玉米收获期含水量及脱水性状表型数据进行全基因组关联分析。主要研究结果如下:1.筛选出10份收获期籽粒含水量低于25%且脱水速率超过1.5%/d的自交系,材料名称分别为SCML17006、SCML17016、NQ231、SCML17100、SCML17112、06H213、78580-494112、SCML17033、宜13A1和T213;筛选出9份生理成熟期籽粒含水量低于35%且收获期籽粒含水量低于25%的自交系,材料名称分别为绵0693、SCML17115、宜14A19、宜0172、9H1922、SCML17042、SCML17043、3732-3和宜018。2.通过GBS技术在290份玉米自交系中开发了13,697个高质量SNP标记。相邻两个SNP标记间的平均距离是157 kb,在全基因组上的连锁不平衡(LD)衰减距离为100-250 kb。基于SNP分子标记的群体结构分析将该批自交系群体划分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个亚群即Tem-tropic群、Impro-local群、Impro-tropic群,分别包括129、42和85份自交系,其余34份自交系为MIX群。3.运用全基因组关联分析,定位到9个与生理成熟期籽粒含水量显著相关的SNP位点,分布于第2、5号染色体上,筛选到4个候选基因Zm00001d003929、Zm00001d013247、Zm00001d014064和Zm00001d005963。其中Zm00001d014064基因在两个环境被同时检测到。定位到6个与收获期籽粒含水量显著相关的SNP位点,分布在第1、2、4和6号染色体上,筛选到5个候选基因Zm00001d001837、Zm00001d030833、Zm00001d007838、Zm00001d052361和Zm00001d038555。定位到11个与籽粒脱水速率显著相关的SNP位点,分布在第1、3、4、5、6和8号染色染上,筛选到12个候选基因Zm00001d042017、Zm00001d042018、Zm00001d042480、Zm00001d052746、Zm00001d052747、Zm00001d052748、Zm00001d017712、Zm00001d012101、Zm00001d028697、Zm00001d034868、Zm00001d021448和Zm00001d008279。