系统性红斑狼疮中Ⅰ型干扰素信号通路相关染色质开放性研究

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目的:本研究以染色质可及性为切入点,旨在研究与系统性红斑狼疮密切相关的Ⅰ型干扰素信号通路的表观遗传效应,为疾病的分类诊断和靶向治疗提供新的思路和线索。方法:首先利用ATAC-seq技术鉴定Ⅰ型干扰素处理后人单核细胞中染色质开放性发生变化的区域。接下来,继续运用ATAC-seq检测经表观遗传分子BRD4的抑制剂(+)-JQ1预处理单核细胞后再进行干扰素刺激的染色质可及性变化。进一步,将RNA-seq与ATAC-seq数据进行联合分析,以明确转录组和染色质开放结构之间的关系。最后,运用实时荧光定量PCR检测BRD4表达量与SLE患者中异常活化的Ⅰ型干扰素信号通路的相关性,并用ATAC-seq检测SLE病人中异常活化的I型干扰素相通路相关染色质开放区域以及这些区域被(+)-JQ1处理后的改变,并运用实时荧光定量PCR在基因表达水平上进行验证。结果:人单核细胞在干扰素处理后,干扰素诱导基因相关的染色质区域开放性有明显增强,特别是位于效应性干扰素诱导基因。接下来发现(+)-JQ1预处理后因干扰素刺激而上调的区域能被相对选择性地下调。进一步,ATAC-seq和RNA-seq的数据的联合分析可得两者具备良好的相关性。最后,明确SLE病人中BRD4的表达量与干扰素积分呈现出正相关性,并且其抑制剂(+)-JQ1可降低狼疮患者中异常活化的Ⅰ型干扰素相通路相关染色质开放性,并进一步下调相关基因的表达。结论:人单核细胞在干扰素刺激后,其下游效应基因的染色质开放水平明显上升。BRD4抑制剂(+)-JQ1可以抑制干扰素激活的染色质改变,从而降低了下游基因表达。并且(+)-JQ1亦可在狼疮患者中抑制I型干扰素通路相关染色质开放,并减少干扰素诱导基因的表达。
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