内部审计在保障工程项目质量和效益方面起着至关重要的作用。但目前工程项目内部审计的事后审计方式，因其严重的滞后性、被动性、低效率性等缺陷，已经无法满足工程项目内部审计的需要，这促使内部审计人员寻求一种新的审计方式来取代之。本文拟结合C公司的特点，就如何使用跟踪审计方式来优化公司工程项目内部审计进行探讨。跟踪审计是指及时对工程项目各个阶段或若干重点环节的经济事项进行审计，以帮助被审计单位及时解决存在的问题，促进工程建设得以规范、有效、有序运行的一种内部审计方式。C公司工程项目内部审计只包括施工结算审计和竣工决算审计，这种事后审计解决不了价款认定不合理、建设单位管理不规范等问题。为此，本文采用重点环节跟踪审计模式，根据风险评估水平确定出设计、招投标、实施和竣工验收这四个跟踪审计的重点环节，并进而应对基于跟踪审计的工程项目内部审计内容、审计流程和程序进行重新设计。为做好跟踪审计，公司应从内审队伍建设、审计业绩考核标准建立等方面提供相应的保障措施。使用跟踪审计方式对C工程项目内部审计进行优化，能很好的将事前预防、事中控制和事后监督有机结合起来，实现“质量、速度、效益”的内部审计目标。对C公司工程项目实施内部审计也存在可行性。一方面，一些企业已成功试用跟踪审计，其经验可资借鉴；另一方面，省公司对工程项目内部审计日益重视，C公司近期也加强了相关管理制度建设。同时，C公司跟踪审计的成功实施，也将为其他企业提供一些参考和借鉴。