非营利组织在西方的发展已经较为成熟,但它在我国还处于初级阶段。2008年汶川地震后的多次自然灾害中,NG0在危机时刻快速、有序的行动,引起了社会的高度关注,相应的研究逐渐增多。基金会作为其中的重要组成部分,因其汇集了社会的巨大资金,引起了更多的关注。目前中国非公募基金会的增长速度已经超过了公募基金会,这反映出社会企业和大众社会责任意识的提升,但是过快的增长速度必然会导致一些问题,如果得不到妥善的解决,没有正确的引导,将会影响它们未来的发展,甚至可能会违背为社会服务的宗旨。在我国当前社会制度下,政府是提供社会服务,制定国家政策的主体。中国非公募基金会与政府的关系应该是一种合作的关系,对立或服从的发展模式都不利于社会的发展以及社会公共服务水平的提高,它们面临的问题需要政府的引导和扶持。针对目前非公募基金会的发展状况,论文以南都和大益爱心两个基金会与政府合作的情况为案例,分析了它们之间的关系模式,比较了各自的特征。对当前非公募基金会与政府关系的现状进行研究,分析了它们与政府合作的条件,在对现有问题进行成因分析的基础上提出有利于双方合作的政策建议,进而探讨出一些有利于公益事业发展的合作途径。文章的基本思路是：首先主要描述非公募基金会与政府合作现状,随后详细分析了两个非公募基金会的案例,以上述为基础,进一步论述了非公募基金会与政府合作的条件,主要包括完善的法律法规、高度的社会关注和支持以及一致的合作目标三个合作条件。针对案例研究中的问题及成因,结合目前其他的合作实践,对当前两者合作的状况进行分析,进而提出了对当前它们合作总体水平的一个初判断。根据对二者相关问题的认识和研判,提出了发展深化双方合作效果的建议,侧重于从政府和非公募基金会两个主体角度进行梳理,从意识、制度和组织自律等方面提出提高两者合作效率的对策。