幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片在临床胃粘膜标本检测中的应用评价

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目的:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是已知的引起胃炎、消化性溃疡等一系列上消化道感染疾病的病原菌,甚至能引起胃癌和胃粘膜相关淋巴组织淋巴瘤。质子泵抑制剂(PPI)和两种抗生素联用的三联疗法,广泛应用于幽门螺杆菌的根除治疗,但是其根除率在逐年下降,已从最初的90%下降至80%甚至更低[1-4]。幽门螺杆菌根除治疗失败的主要原因是抗生素耐药、宿主基因多态性以及患者的依从性不好[5-7]。有效治疗和控制幽门螺杆菌感染的关键在于针对患者的情况进行个体化治疗[8-9],而实现个体化治疗的前提是快速准确的检测幽门螺杆菌的耐药性。本研究的目的是考察幽门螺杆菌个体化治疗基因芯片检测法对幽门螺杆菌的检出率和耐药检测的准确性,探讨幽门螺杆菌个体化治疗基因芯片的临床应用价值;探讨幽门螺杆菌对克拉霉素和左氧氟沙星的耐药表型和基因型的关系。方法:胃镜下取胃粘膜,HP分离培养,进行左氧氟沙星和克拉霉素E-Test药敏试验,读取最低抑菌浓度(MIC)值,判断耐药性。提取胃粘膜DNA,使用幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片对样本进行检测;用PCR测序体系扩增2C19基因片段并进行测序检测。提取胃粘膜临床分离株DNA,进行基因芯片检测,PCR扩增23S rRNA和gyrA基因片段并进行测序检测。PCR扩增菌株23S rRNA和gyrA基因片段,构建质粒,挑取单克隆进行细菌培养,并测序分析。结果:1.幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片与药敏试验两种方法检测克拉霉素和左氧氟沙星耐药的一致率达80%以上。2.幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片与测序两种方法检测克拉霉素和左氧氟沙星耐药的一致率达90%以上。3.幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片与测序两种方法检测2C19基因型的一致率达75%以上。4.幽门螺杆菌存在混合感染。结论:幽门螺杆菌个体化治疗检测基因芯片对胃粘膜幽门螺杆菌耐药检测灵敏度高,特异性好。对克拉霉素和左氧氟沙星耐药检测结果与E-Test药敏试验结果一致性好(Kappa值大于0.75)。基因芯片法快速、准确、成本低、工作量小,在一次实验检测中可同时获得质子泵抑制剂代谢类型和克拉霉素、左氧氟沙星耐药情况,提供PPI和抗生素的选择依据。
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