在日益剧烈的国际竞争环境中,中国如果不进一步深化改革,那么很可能就会错失发展良机。在此背景下,以开放倒逼改革、形成对接国际市场的实验窗口——自由贸易试验区由此推出。自由贸易实验区的设立,是一种全新的尝试,它已经成为中国深化改革、扩大开放的试验田,在贸易、投资、税收、金融等方面都有着特色政策。创新的重要性不言而喻,作为研发创新的主体,企业需要资金、人才以及包容的环境、开放的平台等要素。自贸区的建设可能会通过一系列的政策促进企业的研发创新:其一,自贸区有着优惠的财政税收政策,会对企业的研发创新产生激励;其二,自贸区有一系列的金融开放和创新政策,支持设立外资、中外合资银行,这有利于改善自贸区内企业的融资环境,降低融资约束程度,促进企业研发创新;其三,自贸区的建设有助于形成产业集聚和技术溢出,增加自贸区企业研发创新的可能性。本文的研究有利于明确自贸区的设立对企业研发创新的影响,对自贸区建设的政策效应进行相对系统的评估,在理论方面也丰富了对企业创新影响因素的研究。本文基于企业层面的微观数据,主要考虑前三批即2017年以前设立的自贸区,运用PSM-DID方法研究自贸区设立这一准自然实验对区内企业研发创新投入的影响,研究发现:（1）总体而言,自贸区的设立会对企业的研发创新投入产生正向的影响,PSM-DID回归结果显示,在自贸区设立以后,区内企业的研发创新投入上升0.3个百分点;但是在研发产出方面,却呈现出显著为负的关系。本文还对各批次设立的自贸区进行分别的检验,研究发现,前两批设立的自贸区都对企业的研发创新投入有着显著为正的影响,且促进效应均好于全样本的水平。第三批设立的自贸区对企业研发创新的影响并不显著,原因一方面在于可能第三批自贸区设立时间还较短,政策效果未充分发挥,另一方面在于第三批自贸区设立以后融资环境没有改善,企业新增融资有所下降,进而抑制了企业的研发创新。（2）总体而言,自贸区的设立主要通过减轻税收负担、增加政府补贴、降低区内企业的融资约束、促进人才集聚渠道,提升了企业的研发投入水平,但融资成本没有显著变化,没有起到促进企业创新的作用。在各批设立的自贸区子样本中,企业研发创新的影响机制存在异质性。（3）本文还根据企业性质和规模大小做了异质性分析,在前两批自贸区样本中,国企组和大企业组的研发创新投入在政策实施以后有着显著的上升,但在非国企组和小企业组中则不显著。根据以上结论,本文提出自贸区可试行更多结果导向尤其是有利于促进企业实质性创新产出的政策,同时,还需要在适当降低企业融资成本方面做出努力,以自贸区的金融开放为契机进一步推动利率市场化改革,大力发展数字普惠金融,缓解企业尤其是中小企业融资难、融资贵的问题,促进中小企业发展等政策建议。