大白菜叶面刺毛突变基因Brtrm的精细定位

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wy85396021
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叶片刺毛性状是叶片毛状体形态的一种,广泛存在于植物体中。在黄瓜、辣椒、拟南芥、芥菜等植物中均有不同形态的刺毛。刺毛的生长位置多样,功能也不尽相同。叶片刺毛可提高植物体的抗草食性、抗虫性、抗逆性等,叶片刺毛性状在标记选择辅助育种中也可以作为一些性状的指示标记。大白菜(Brassica rapa pekinensis)叶片刺毛性状研究甚少。叶片刺毛存在叶片边缘刺毛和叶面刺毛两种情况,其中,叶面刺毛较为少见。且叶边缘刺毛常伴随叶面刺毛发生。本试验以大白菜双单倍体纯系(Double haploid line,简称DH系)’FT’为试验材料,采用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变萌动种子的方法,创制出具有多种突变表型的突变体,从中挑选叶面有刺毛、遗传稳定的突变体trm进行突变性状鉴定和突变基因定位,结果如下:1.将野生型’FT’与突变体trm正反交、回交、自交,得到后代、、,观察后代表型。通过此六世代表型及分离比例分析,得到:后代均为野生表型、与野生型亲本回交后代全为野生表型、与突变体亲本回交后代野生表型与突变表型出现1:1分离比例,表型符合3:1分离比率,证明突变体trm的叶面刺毛性状属于细胞核单基因隐性遗传。2.将突变体trm与白菜薹’701’杂交得到F1,F1自交得到分离群体,从中选取突变表型与野生表型植株各50棵建立两个极端池。对两混池进行RNA测序,利用BSR-Seq技术,参照大白菜数据库2.5版本,将突变位点定位在A06染色体上2034489 bp长度区段内。进一步开发SSR标记和In Del标记进行精细定位,最终将突变位点定位在标记I31与标记I38之间,遗传距离分别为0.12 c M和0.20c M,两标记间的物理距离为82.9 Kb,该区间内有13个基因。3.通过对野生型’FT’与突变体trm的DNA进行重测序,筛选出候选基因Brtrm,突变发生在Bra A06g043560.3C基因的第10个外显子上,第2120个碱基由鸟嘌呤(G)突变为腺嘌呤(A),使得第707位氨基酸由丙氨酸(Alanine)突变为缬氨酸(Valine),导致蛋白结构上增加一个苯环,功能发生改变。该突变基因与拟南芥中与AT5G43810基因同源。在拟南芥中,该基因调控AGO10蛋白的表达。AGO10蛋白可通过下调ARF2介导的生长素来控制分生组织干细胞的发生;也可通过抑制mi R165/166抑制离体芽再生。
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