21世纪以来,国家给农业类上市公司提供了很多的税收减免、财政补贴等优惠政策,但是农业上市公司财务舞弊的事件仍然经常发生,从2002年的“蓝田股份”到2012年“万福生科”再到2015年的“獐子岛事件”,从侧面反映出注册会计师在对农业上市公司进行审计时,可能没有把现代风险导向审计模式运用到审计工作中,对农业上市公司特有的经营风险和重大错报等风险缺乏足够的职业判断,导致其没能及时的识别和规避农业上市公司的审计风险,以致社会公众和中小投资者质疑审计行业的专业胜任能力、独立性和信誉度。本文站在注册会计师角度,探讨审计农业类上市公司时,注册会计师都面临哪些审计风险?并以獐子岛事件为例,重点分析目前注册会计师在审计过程中是如何运用的现代风险导向审计模式的、都存在哪些方面的问题和不足,由此可以帮助注册会计师更好的识别农业上市公司的审计风险,依据实际情况来制定正确的审计计划,规避农业类上市公司审计失败的发生,保护中小投资者的利益,促进资本市场的良性发展。本文在借鉴了已有研究成果的基础上,首先,阐述了审计风险的概念及模型、现代风险导向审计模式含义与特征,再结合我国农业行业的业务特殊性,得出我国农业上市公司特有的审计风险以及主要审计风险点等内容,为本文的研究奠定了理论基础。其次,以“獐子岛事件”为例,重点研究注册会计师在审计实务中采用的风险评估程序以及规避审计风险的具体措施,分析得出注册会计师在对农业上市公司进行审计的过程中存在的一些问题。最后,针对注册会计师在审计“獐子岛事件”中所存在的问题与不足,以注册会计师的角度,并以现代风险导向审计模式为出发点,有针对性的提出应始终贯穿风险管理思想、有针对性的运用审计程序、创新审计技术和方法、提升专业胜任能力等几方面的对策与建议,为现代风险导向审计在我国农业上市公司审计中的应用提供一些参考,以提高注册会计师对农业上市公司审计风险的控制水平。