延胡索稀有内生放线菌的筛选、鉴定及其抗菌活性研究

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植物内生放线菌是指在植物体内生活又对植物不产生明显危害的一类放线菌。长期与植物共生过程使植物内生放线菌形成了相对特殊的生理与代谢特点,这使植物内生放线菌成为了一种极有价值的微生物资源。随着酶、抗生素等一系列新的具有极强活性的化合物不断从植物内生放线菌中被分离出,植物内生放线菌的重要性日益引起生物学家、化学家以及农学家的兴趣与注意。本实验以采自黑龙江省五常市凤凰山风景区的一种传统的药用植物延胡索样品为分离源,使用高氏一号、HV和改良高氏二号等十种培养基,以浓度为50mg/L的萘啶酮酸、浓度为20mg/L放线菌酮组合为抑制剂,总共分离到放线菌78株。使用十字交叉法点接测定78株放线菌对十种真菌的抑菌活性,发现14株放线菌菌对至少4种真菌具有抑制作用。通过在培养基上的形态特征的比较,发现YHS9、NEAU-YHS12、NEAU-YHS15、YHS37和YHS39的培养形态比较特殊,对这五株菌株的16S rRNA进行了基因序列测定并使用Ez Taxon-e网站进行比对,得出结论YHS9属于链霉菌属,YHS37、YHS39属于小单孢菌属,NEAU-YHS12与NEAU-YHS15属于球包囊菌属,对NEAU-YHS12与NEAU-YHS15进行了多相分类学鉴定。Ez Taxon-e网站比对显示NEAU-YHS12和NEAU-YHS15属于球包囊菌属,与NEAU-YHS12和NEAU-YHS15相似度最高的菌株分别为为Sphaerosporangium cinnabarinum JCM 3291T(98.7%,98.6%),Sphaerisporangium flaviroseum YIM 48771T(98.6%,98.6%),Sphaerosporangium melleum JCM 13064T(98.5%,98.4%)和Sphaerisporangium dianthi NEAU-CY18T(98.4%,98.4%)。基因对比发现NEAU-YHS12和NEAU-YHS15的16s r RNA序列相似度为99.8%。菌株NEAU-YHS12和NEAU-YHS15与球包囊菌属的所有典型菌株以邻位连接法(Neighbour-Joining)与最大似然法(Maximum-likelihood)两种方法构建系统发育树,得到两株进化树拓扑结构一致,菌株NEAU-YHS12、NEAU-YHS15与第二高相似度的Sphaerisporangium flaviroseum YIM 48771T形成独立分支,然而其分支上的低靴值不支持此分支。菌株NEAU-YHS12和NEAU-YHS15的表型特征、化学分类特征与系统进化特征基本相同,同时又都符合球包囊菌株的特点。但NEAU-YHS12和NEAU-YHS15的DNA杂交值大于70%。故而菌株NEAU-YHS12和NEAU-YHS15确定为球包囊菌属的一个新种,命名为Sphaerisporangium corydalis,代表菌株为NEAU-YHS15,同时分别保藏于中国科学院微生物研究所(CGMCC 4.7148T)和德国不伦瑞克市微生物菌种保藏中心(DSM 46732T)。
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