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柑橘溃疡病（Citrus canker）为世界检疫性病害,是柑橘重要的病害之一,在我国主要由柑橘黄单胞柑橘亚种（Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc）引起。为了明确湛江地区柑橘溃疡病的病原类型并筛选出有效的防治药剂,本研究以染病柠檬叶片为材料进行病原菌的分离鉴定,利用Nanopore三代测序技术平台进行病原菌全基因组测序,采用平板稀释分离、形态学观察和16S序列分析对病叶内生菌分离鉴定后进行平板对峙试验,检测内生细菌与柑橘黄单胞的相互作用,并通过抑菌圈法检测了几种常用药剂对柑橘溃疡病菌的抑制效果。1.从疑似柑橘溃疡病的柠檬病叶上分离到病原菌菌株zlm1908,通过形态学观察、生理生化指标测定及分子生物学鉴定,确定该病原菌为柑橘黄单胞柑橘亚种（Xcc）,离体接种在柠檬和红江橙叶片上,均产生典型的溃疡症状。2.全基因组测序结果表明菌株zlm1908的基因组大小为5.19 Mb,含有1条5,192,880 bp的染色体和2条长度分别为34,099 bp和119,114 bp的环状质粒,GC含量为64.67%。比较基因组研究发现菌株zlm1908与源自江西的jx-6菌株在CRISPR、基因岛、t RNA及前噬菌体数量以及质粒大小上都有较大的差异。3.从柠檬病叶中共分离到14种42株不同的内生细菌,通过平板拮抗试验从内生细菌中筛选到一株对柑橘溃疡病菌有良好抑制效果的解淀粉芽孢杆菌BA（Bacillus amyloliquefaciens）。实验室保存的三株芽孢杆菌BL、SN和KC对zlm1908也表现出很强的抑制作用。4株芽孢杆菌对zlm1908的平均抑菌圈直径分别为、、和。4.不同药剂的抑菌结果显示:46%氢氧化铜WG、27.12%碱式硫酸铜SC、枯草芽孢杆菌WP、12%中生菌素WP和50%氯溴异氰尿酸PX五种药剂的EC50值分别为18.45 g/L、14.99 g/L、5.28 g/L、14.60 g/L和32.81 g/L。从EC50的大小可以看出五种杀菌剂中枯草芽孢杆菌对菌株zlm1908的抑制作用最强,其次为12%中生菌素、27.12%碱式硫酸铜、46%氢氧化铜,50%氯溴异氰尿酸的抑制作用最弱。综上,通过形态学观察、分子生物学等鉴定病原菌,对其进行全基因组测序并开展有效药剂和拮抗菌株的筛选,旨在明确湛江地区柑橘溃疡病菌的类型,并为柑橘溃疡病的大田防治提供理论依据。