水杉木材DNA提取及DNA条形码分析

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-直以来,木材的经典鉴定工作都建立在木材的形态学和解剖学的基础上,而由于在分类学中近缘物种的木材结构非常相似,这给木材鉴定工作带来了许多的困难。如果木材可以很容易地使用DNA检测手段进行研究,那么,这会在木材鉴别,认证,考古学和古植物学上得到更广泛的应用。而解决这个问题的关键在于木材中DNA的提取以及有效的比对鉴定方法,国内外对此方面的研究报道甚少。因此,探讨木材中DNA的提取方法以及木材DNA分子水平鉴定的有效途径,不仅具有理论学术上的意义而且有较好的应用前景。本研究首先采用不同的DNA提取方法对现生水杉木材进行DNA提取,并对其提取过程进行优化,在此基础上,对不同部位的木材,以及取材保存不同年限的木材进行DNA提取及DNA片段的扩增。最后,使用DNA条形码的研究标准,对选择扩增的片段进行了筛选。结果显示,现有的DNA提取方法在改进之后可以很好地进行木材细胞的DNA提取,对于木材DNA的提取来说,研磨、温浴时间和沉淀时间尤为重要;在木材不同部位的DNA提取中发现,边材、心材中DNA含量依次减少,且心材中DNA比边材中更容易降解;对于保存不同年限的木材而言,随着材料离体后时间的延长,DNA进行持续地降解,保存两年内的水杉木材可以提取到完整的基因组DNA,但保存5年以上的木材基本无法提取到完整的基因组DNA,而PCR扩增也只能扩增到750bp以下的片段,对于长年埋藏于地下的阴沉木来说,实验证明,PCR扩增是无法进行的。运用DNA条形码比对筛选分析,即序列特征分析,遗传距离秩和检验,barcoding gap检验,表明序列ITS2、tmL-F均比较符合DNA条形码的要求,可以作为杉科木材鉴定的序列。
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