贵阳市生态文明建设委员会是生态文明建设和环境治理又一创新生态文明体制机制。贵阳市生态文明建设委员会2012年成立以来,在贵阳的生态文明建设和环境的治理方面取得了一定的成效,但是在政府部门间协调上仍然存在着很多的问题。因此,以贵阳市生态文明建设委员会这样一个创新机制为样本,对其政府部门间协调的现状、存在怎样的困境以及怎样突破困境等方面进行探讨成为本文的核心议题。本文从府际理论和整体性政府理论出发,围绕贵阳市生态文明建设委员会部门机构设置、协调机制设计、领导能力、协作过程以及部门间合作现状五个维度来对政府部门间协调进行描述。此种全新的部门间协调体制机制解决了之前分散的部门机构重叠、职能交叉、部门林立、数量过多等情况,通过横向和纵向的协调,大大的改善了之前协调困难的情况。这是一种新型的政府部门间协调形式,但是其自身在上述的五个维度依然存在着困境,面临着例如机构设置过多、人员编制不足、法制化和规范化的程度不足、缺乏合作激励机制、领导协调方式单一协调能力不足、协调过程具有随意性、部门间自主合作理念的缺乏等等问题。最后,针对贵阳市生态文明建设委员会所存在的困境,从府际理论和整体性政府理论的视角出发,总结国外相关经验,通过采取加强部门机构整体的有机整合、完善相关协调机制、提升领导协调能力、重视协调过程、提升部门间合作意识,促进部门间合作等方面的路径来应对贵阳市生态文明建设委员会在政府部门间协调上所出现的困境。