野菊(Chrysanthemum indicum L.)是菊科(Asteraceae)菊属重要的野生资源。目前,关于菊属植物的细胞学研究主要集中在染色体倍性、染色体分带、核型分析、减速分裂行为和染色体原位杂交等方面,其中核型分析是植物分类和遗传研究的重要手段。野菊的核型分析主要是通过传统的压片法进行染色体制片,根据其染色体的形态,大小进行配对分组分析核型,该种方法难以精确识别全部的染色体,对染色体相似度较高的物种的核型分析更是困难。而荧光原位杂交技术依据碱基互补原理,能够准确定位特殊修饰的核苷酸分子探针在染色体上的位置,可以为核型分析提供更多的可识别的标记。在菊属植物中,利用荧光原位杂交技术进行核型分析的研究较少,一方面是因为荧光原位杂交技术对染色体制片的质量要求较高,另一方面是因为缺少好的标记探针以及开发标记的方法。基于此,本研究在优化野菊制片方法的基础上,通过基因组测序的方法从野菊基因组中挖掘重复序列,开发标记探针,建立了适于野菊的荧光原位杂交体系,初步分析了玉米45S r DNA、5S r DNA和重复序列YJ223-5在野菊中期染色体上的分布特点,并根据三个探针的荧光原位杂交结果分析了野菊的核型。主要研究结果如下:1、采用扦插和组培两种不同的生根方式,解决了野菊秋冬季根尖获取困难的问题。并针对不同的取材,对制片过程进行调整,均获得了分散程度高、清晰度好的染色体制片。2、对去壁低渗火焰干燥制片进行调整,筛选最佳预处理条件和酶解时间,综合得到最佳制片体系为:8-羟基喹啉处理3h或冰水处理16小时,混合酶液(纤维素酶:果胶酶=2:1)酶解90~100min。3、利用流式细胞仪对野菊基因组大小进行估算,得到四倍体野菊基因组大小约为6.36Gb。4、对野菊进行基因组测序,得到6Gb的测序数据,用基于图形聚类的方法对重复序列进行分类并进行注释。结果显示四倍体野菊重复序列约占总基因的68.61%,其中42.31%为散在重复序列,26.3%为串联重复序列。5、玉米45S rDNA探针在野菊中期染色体上有9个信号点,分布在3号、6号、8号染色体的末端,5S r DNA探针在野菊中期染色体上有3个信号点,分布在4号染色体的亚末端,YJ223-5探针在野菊中期染色体上有8个信号点,分布在2号、4号、8号染色体的末端,其中有两条染色体的末端都有信号。根据信号位点的数目和分布位置,并结合染色体核型参数,分析了野菊的核型,得到野菊的核型公式为2n=4x=36=24m(2SAT)+12sm,属于2A核型,在系统进化中属于较为原始的种。