遗传多样性是生物多样性的重要组成部分，其表现形式通常是多层次的，对其研究也常体现为多层次、多水平。本研究以披针莲座蕨(Angiopteriscaudatiformis)为研究对象，选择云南大学植物标本馆馆藏的16个居群标本及2005年采自西双版纳州的6个居群新鲜样品为材料，从形态学和DNA分子标记两方面对其居群遗传多样性进行探究，利用基本统计分析、相关分析、聚类分析的SAS、POPGENE等软件对形态学、分子标记等实验结果进行了统计分析，主要结果如下： 1.12个重要形态学性状指标平均值、方差、标准差、变异系数等基本统计分析表明，披针莲座蕨植物的形态学性状遗传差异较大，变异系数达到了88.00％，各个性状在居群内的变异系数达20.53～51.59％；生殖性状(36.01％～75％)的变异幅度低于营养性状(23.67％～88％)的变异幅度；形态学性状的相关分析表明，各性状之间存在明显的相关性(相关系数为0.121～0.668)；巢式方差分析结果显示平均有81.99％的变异来自于居群内的个体间，而仅有7.49％的变异来自于居群间，说明披针莲座蕨的变异主要来自于居群内个体间，居群内多态性丰富。 2.筛选并建立了适合于披针莲座蕨ISSR的扩增程序和反应体系。反应体系为：在25ul总反应体系中，含模板DNA32ng/ul,Taq聚合酶2U，dNTP0.2mmol/L，引物1.3mmol/L，Mg2+1.5mmol/L。确定了扩增程序为：94℃预变性5分钟；94℃变性45秒，48-52℃复性1分钟，72℃延伸1分钟，38个循环；72℃延伸5分钟，4℃保存。 3.筛选的11个随机引物对6个居群共97个个体样本进行了ISSR扩增，共扩增出81条带，其中多态性带为79条，多态性位点百分率(PPB)为97.5％。6个居群中西双版纳植物园2个居群(P3、P4)的PPB最大，为75.3％，爱伲古寨2个居群(P2、P6)的PPB最低，为65.4％；6个居群平均PPB为58.7％。6个居群中P3、P4的遗传多样性最高，其生境保护的最好，P6遗传多样性最低，生境严重遭受破坏可能是导致其遗传多样性降低的一个重要因素。香农-威纳指数(I)统计结果与PPB统计结果相似：P3和P4居群的香农-威纳指数值最大，为36.3％和35.6％，P6最小，为30.6％。居群问香农-威纳指数(I)、Nei基因多样性指数(H)和基因分化指数(Gst)，分别为0.41、0.26和0.18，Gst表明18％的变异来自于居群间，而82％的变异存在于居群内，说明居群内遗传多样性较高。 4.UPGMA聚类结果表明，6个居群分成两支，一支包括爱伲古寨热带雨林2个居群(P1、P2)、西双版纳植物园2个居群(P3、P4)和P5居群，另一支仅包括P6居群。6个居群的聚类结果与其地理分布特点基本一致，即地理位置较近的居群首先聚成一支。