近红外荧光蛋白的分子进化及其光学性质研究

来源 :湖北大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong557
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近红外荧光蛋白的最大激发和发射波长都处于组织成像"光学窗口"的范围内,使其在活体深层组织成像中得到广泛的应用。研究人员可以将该类蛋白标记上自己感兴趣的分子,从而可以直观、动态的监测该分子在活体中的所可能发挥的作用。这种利用荧光成像的方式进行研究的手段,为生物领域的快速发展提供了又一个强有力的技术支持。尽管,目前已经少数近红外荧光蛋白产生,但是这些荧光蛋白仍有进化的空间,部分光学性质仍需要改善,如,激发和发射波长的红移,pH稳定性,单体性质,量子产率增加,成熟速率加快等。这些性质对荧光蛋白运用于体内成像具有重要意义。关键性质,一直是研究者们对荧光蛋白进化时的主要指标。近年来我们实验室通过体外进化,获得了系列近红外荧光蛋白。其中,mNeptune684拥有目前最长的发射波长,其最大激发/发射为604/684 nm。然而,稍微遗憾的是,其量子产率仅为0.03,由于结构的原因,当发色团处于的平面性得到确保并且其旋转的自由度也同样受限的环境中时,才会产生较高的量子产率,而随着荧光蛋白波长的红移会逐渐增加维持上述环境的难度,最终导致波长越红移,其量子产率越低的现象,因此限制了该蛋白在体内成像中的运用。本研究将从提高量子产率方面来对该荧光蛋白进行改造。研究思路是通过对蛋白晶体结构分析理性设计以及随机突变的方式来共对mNeptune684进行体外进化,其关键在于保证mNeptune684荧光蛋白的发射波长不会发生蓝移的前提下,尽可能的提高其量子产率。具体实验主要分为以下两个方面:其一,参考其他研究者们对ECFP的β折叠片的改造,来稳定发色团结构,从而提升量子产率的方法,对mNeptune684的β折叠也引入类似的理念。文章中提到将ECFP第七折叠片中148位的His突变成Asp后,第七β-折叠片与第十β-折叠片形成更为稳定的氢键相互作用,从而稳固的发色团的外部结构,最终达到稳定发色团的效果。而对于mNeptune684这个蛋白,通过晶体结构的分析,我们发现该蛋白桶状结构中第七个β-折叠片上有一段无规卷曲,从而使结构较为松散,而该螺旋涉及141/142两个位点的氨基酸,并着手对其进行突变。在此期间我们通过二级结构预测软件来缩小突变氨基酸的范围,但是所得突变体不是丢失了荧光就是发射波长蓝移,因此没有得到满意的结果;其二,回归到对发色团周围氨基酸的分析,从氨基酸侧链与发色团之间氢键相互作用入手,来发现能稳定发色团的突变。同样通过晶体结构分析,在mNeptune684中Asn143和Asn158扩展了发色团周围的氢键网络,对其光谱红移起到了很大的作用,同时还有Arg155、His157和Pro159之间的氢键作用,使得发色团的空间构象得到稳定。由于上述氨基酸突变都集中在发色团对羟基苯亚甲基(p-hydrroxybenzylidene)基团周围,所以本研究选取的突变位点都集中在发色团的另一头,酰基亚胺(acylimine)基团的周围。经筛选,最终得到将Metll突变成Val的突变体mNeptune684_M11V,其量子产率为0.07,与亲代的mNeptune684相比有近2.5倍的提高,并能运用到细胞进行成像,未来,我们将尝试将该蛋白应用于动物活体成像。
其他文献
采用吸热型碳氢燃料作为冷却剂的再生冷却可以有效地解决超燃冲压发动机的热防护问题。通常用于流量测量的差压式流量计和用于壁面冷却的冷却通道是再生冷却系统的重要组成部
偏微分方程理论可以被应用在许多科学领域,例如生物学,物理学,化学,工程学,控制理论,人口增长模型和气候模型。在过去几年,带有偏差变元的偏微分方程的基础理论的研究得到了
设S是序幺半群.文献[14]中证明了所有强平坦的序左S-系是I-正则的当且仅当S是左PP且左半完全的序幺半群.本文第一部分证明了上述结论中的左半完全性可被更弱的性质(FP2)代替或
研究多维分布时需要考虑其相关性问题,用Copula函数来描述变量间的相关结构,不需要每次计算相同的边缘分布,且任意边缘分布都可以通过Copula函数构造联合分布。因此,许多国内
恢复和保育生态系统服务功能既是人类生存和现代文明的基础,也是实现可持续发展的前提。研究与探讨喀斯特石漠化地区不同土地覆被对生态系统服务功能的影响机制,可为我国西南
图G=(V,E)的边着色是一个映射c:E(G)→S,使得任意两条相邻的边e和f,满足c(e)≠ c(f).图的强边着色是图的边着色并且要求在图中和同一边相邻的两条边也要着不同的颜色.换而言之,在强边
图G的无圈k-边染色是指图G的一个正常边染色且不产生双色圈的k-边染色.图G的无圈边染色数χa’(G)是使得图G有一个无圈k-边染色的最小整数k.在1978年,Fiamcik提出了任意图的
对逻辑代数系统的研究是非经典数理逻辑的一个重要研究方向,为了进一步揭示弱MTL-代数的特性,本文从多个方面对其进行了再研究.首先,讨论了弱MTL-代数的性质,澄清了它与其它
本文研究下面的四阶非线性椭圆边值问题:其中△2是双调和算子,Ω为RN中的具有光滑边界的有界开区域,c∈R.在工程实际中,含有双调和算子的四阶椭圆问题△2u+c△u=f(x,u),z∈ΩQ
自动机理论是计算理论的数学模型,是可计算、算法描述和分析、计算复杂性理论等问题研究的基础.在自动机理论中,一个重要的研究课题是自动机与文法的等价性.在经典自动机理论