在梳理借鉴现有行业分析模型和盈利模式分析模型的基础上,本文设计了适用于我国国情的战略性新兴产业分析模型和企业盈利模型,并利用这两个模型分析了我国基因组学应用产业及其核心企业华大基因。本文提出的战略性新兴产业分析模型由四个象限和四个对象组成,四个象限由产业领域、科技创新、人才教育和政府政策组成;四个对象由行业、企业、科研机构和政府组成,该模型从系统分类的视角对产业进行分析。企业盈利模式分析模型则设计为一个四纵三横的结构,每个纵向上由三个盈利要素组成,形成该方向上的一种力量,分别为资源整合能力、产品和服务能力、利益相关者能力和财务能力;每个横向上由四个盈利要素组成,形成该方向上的一种流向,分别为风险流、信息流和现金流,通过以上的设计对被研究企业进行系统性综合分析。对基因组学应用行业的分析发现,行业技术的进步降低了产业进入门槛,加剧了市场竞争。目前行业发展的主要问题包括科研投入不足、缺少核心技术、行业准入和监管不到位以及行业风险意识不足等。利用自主构建的企业盈利模型对华大基因的盈利模式进行识别,发现华大基因在现金流上存在产品供给和运营能力不足的问题;在信息流上存在销售费用占比过高和研发投入不足的问题;在风险流上存在着风险控制建设不到位和人才严重流失的问题。以上问题综合导致华大基因的企业竞争优势和企业盈利能力在逐渐丧失。最后对基因组应用行业和华大基因公司分别提出相应战略发展建议。