皮肤癣菌病为全球第四大常见疾病，且皮肤癣菌感染后极易复发。絮状表皮癣菌为临床上常见的皮肤癣菌之一，易感染皮肤以及甲，头发感染甚为少见。在印度、伊朗等国家其感染发病率可高于红色毛癣菌、须癣毛癣菌、犬小孢子菌等常见皮肤癣菌。絮状表皮癣菌在分类学上单独成属，其在致病性和生态习性上也有着独特的一面。因絮状表皮癣菌为亲人性皮肤癣菌，缺乏相应的动物模型，现有的分子、组学等研究工具也仅应用于毛癣菌属和小孢子菌属的皮肤癣菌，目前有关絮状表皮癣菌的基本特征，包括分子生物学、组学、致病机制等研究还有很多空白，因此本文主要侧重从这些方面对絮状表皮癣菌展开系统的研究，以揭示絮状表皮癣菌的生物学特征以及与宿主相互作用的具体机制。
　　首先我们对本实验室收集到的19株絮状表皮癣菌进行体外形态和酶解反应的分析，结果表明絮状表皮癣菌在土豆培养基上可呈现4种不同的形态特征，角蛋白酶和脂酶活性比其他临床常见皮肤癣菌弱可能与其易感部位、生态习性有一定的相关性。利用多基因位点(ITS、CHS-1、BT2、LSU)分型和AFLP的方法将絮状表皮癣菌分为四种主要的基因型，但未能证实这种分型与形态、酶解活性以及地域有相关性。
　　在本文的第二章中我们联合二代和三代测序技术完成了对絮状表皮癣菌的高质量全基因组测序，对基因组进行功能注释发现絮状表皮癣菌自身有一套完整的能量和核酸代谢系统以适应不同的环境。通过比较基因组分析发现絮状表皮癣菌基因组为现有皮肤癣菌基因组中最大的，且存在方向的不一致性，推测这种现象与其基因组中的Tf2和Tc1-mariner转座子相关。在全基因组水平进行系统进化分析发现絮状表皮癣菌与石膏样奈尼兹皮菌系统发育关系最近，进一步比较分析得出絮状表皮癣菌的生态习性和致病特点可能与以下因素有关:1)黏附因子的种类和数量尤其是1，3-beta-glucanosyltransferasegel3;2)角蛋白水解有关的Cdo1、sub1、sub3、sub7的数量;3)CAzy家族中的CEs和CBMs的数量;4)LysM结构域的种类和数量;5)丝氨酸/苏氨酸蛋白结构域。另外我们在分子和基因组的水平揭示了絮状表皮癣菌采用经济节约的无性繁殖的方式进行繁殖，交配型为MAT1-2型。
　　最后我们利用RNA-seq和dualRNA-seq技术对絮状表皮癣菌在体外以及与人HaCaT细胞互作的基因表达进行分析研究，主要目的是为了揭示絮状表皮癣菌的蛋白水解及与宿主相互作用过程中的关键调控基因，为临床上的分子标记和靶向治疗奠定基础。研究结果表明与起源关系最近的石膏样奈尼兹皮菌相比，絮状表皮癣菌在蛋白水解的各个环节都有其独特的调控机制。金属蛋白酶和DPPV为絮状表皮癣菌蛋白水解的关键调控基因，FAD、MFS转运蛋白、磷脂酶D为絮状表皮癣菌入侵宿主细胞的重要毒力因子，KRT75基因的表达可能与毛发的感染有关，CDC7蛋白激酶可能为无性繁殖的关键调控机制之一。对于细胞而言，絮状表皮癣菌的入侵造成了其结构和功能的破坏，与此同时，与细胞增殖分化、细胞骨架、细胞外基质重塑等有关的基因表达上调以对抗絮状表皮癣菌造成的损伤。