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马铃薯是世界上四大粮食作物之一,具有产量高、经济效益高等优点,生产上马铃薯连作种植造成马铃薯产量和品质下降,马铃薯连作障碍日益严重,合理的轮作可以打破连作障碍,保障马铃薯产业健康发展。本研究通过设置6种不同的种植方式,通过分析不同种植方式下土壤可培养微生物、土壤酶活性、土壤微生物多样性变化、及主要致病菌的丰度变化,探索马铃薯真菌病害的生防基础,为马铃薯主要病害的防治提供数据支撑。主要研究成果如下:1.可培养微生物测定结果表明:不同种植方式微生物数量无明显的变化规律,但是连作种植下土壤真菌数量高于轮作,且土壤细菌数量减少,真菌数量增加,土壤由细菌型向真菌型转变。2.春小麦-马铃薯轮作（A组）、春小麦-莜麦轮作（B组）、莜麦-马铃薯轮作（C组）、莜麦-大豆轮作（D组）、豌豆-马铃薯轮作（E组）、马铃薯连作（F组）种植方式下,土壤过氧化氢酶和多酚氧化酶活性在2019年苗期达到最大值,在2019年苗期,过氧化氢酶活性分别为36.24μmo L/d/g、31.91μmo L/d/g、39.56μmo L/d/g、35.97μmo L/d/g、42.59μmo L/d/g、34.30μmo L/d/g;A-F种植方式下,在2019年苗期,多酚氧化酶活性分别为163.36 mg/d/g、178.36 mg/d/g、168.64 mg/d/g、141.60 mg/d/g、154.40 mg/d/g、166.48mg/d/g;脲酶和蔗糖酶活性在2019年膨大期达到最大值,A-F处理种植下,在2019年膨大期脲酶活性分别为1073.70μg/d/g、916.04μg/d/g、980.98μg/d/g、1094.47μg/d/g、1202.05μg/d/g、1179.75μg/d/g,A-F种植方式下,在2019年膨大期蔗糖酶活性分别为105.39 mg/d/g、76.25 mg/d/g、77.96 mg/d/g、62.21 mg/d/g、76.81 mg/d/g、44.26 mg/d/g。且2019年酶活性高于2018年。3.微生物多样性分析结果表明:不同种植方式下,土壤真菌群落组成已出现明显差异,细菌群落组成差异不明显。2019年不同轮作方式下各时期的OTU数均高于连作。轮作种植方式下,真菌群落丰富度及多样性高于连作,在2019年苗期,轮作种植方式下,细菌群落多样性及丰富度高于连作,在2018年膨大期,轮作种植方式下,细菌群落丰富度高于连作。各种植方式下,真菌的优势门为子囊菌门（Ascomycota）、Mortierellomycota、担子菌门（Basidiomycota）,优势属为被孢霉属（Mortierella）、赤霉属（Gibberella）、镰刀菌属（Fusarium）。细菌的优势门为放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）,优势属为节杆菌属（Arthrobacter）、类诺卡氏菌属（Nocardioides）、鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）。通过轮作可增加土壤中被孢霉属（Mortierella）、毛壳菌属（Chaetomium）、节杆菌属（Arthrobacter）等菌属的丰度,降低赤霉属（Gibberella）、镰刀菌属（Fusarium）等菌属的丰度。环境因子关联分析结果表明:土壤多酚氧化酶、脲酶、蔗糖酶、过氧化氢酶活性均极显著影响真菌及细菌的群落组成,与真菌及细菌群落组成中的门和属有显著相关性。4.马铃薯病害病原菌定量结果表明:F种植方式下,各时期大丽轮枝菌及腐皮镰孢菌数量均处在较高水平,其中在2019年苗期,F种植方式下,大丽轮枝菌数量最高,高达52.52×103 copie/g,且差异显著。5.拮抗菌筛选结果表明:共筛选到5株拮抗细菌,其中YM128菌株对立枯丝核菌、腐皮镰孢和TD2（Fusarium graminearum）的抑菌率均为最高,分别为94.15%、49.57%、71.86%。YM93菌株对TD1（Fusarium sambucinum）的抑菌率最高,为86.05%,显著高于其他菌株。6.拮抗菌防效测定结果表明:接种致病菌TD1 F.sambucinum 30 d后,喷施拮抗菌XM23、P76的马铃薯也出现小面积病斑,而喷施拮抗菌YM93、YM128、YM173的马铃病斑扩展不明显,防效较好。在60 d时测定马铃薯的失重率及硬度,结果表明:接种致病菌TD1的马铃薯失重率为5.32%,喷施拮抗菌株YM173的马铃薯失重率较低,效果较好。喷施拮抗菌株XM23的马铃薯失重率为18.81%。综合抑菌率及对马铃薯的防效测定结果,筛选出YM173为1株抑菌效果良好的拮抗菌株,经初步鉴定为解淀粉芽孢杆菌。