代谢组学是系统生物学研究的重要组成部分,在疾病和药物研究中已显示出卓越的发展潜力。本论文应用LC/MS的代谢组学平台分别对中医证候及动脉粥样硬化的物质基础、中药通心络药效进行研究。主要研究结果如下：首先,对尿液和血浆样品的预处理方法、分析方法分别进行了优化,确定了UFLC/MS-IT-TOF的最佳分析条件。在疾病研究方面,以动脉粥样硬化模型大鼠的血浆和尿液为对象,采用主成分分析(PCA)对其代谢谱进行研究,发现胆汁酸、溶血磷脂酰胆碱代谢上调和氨基酸的代谢上调。在中医证候研究方面,以过度疲劳(气虚证)和抑郁(气郁证)模型大鼠血浆和尿液为对象,发现烟酸和烟碱、精氨酸、胆固醇、色氨酸、磷脂、能量等多个代谢途径发生了变化。对过度疲劳-动脉粥样硬化复合大鼠模型进行代谢组学研究,发现模型大鼠体内的胆汁酸代谢上调,而氨基酸代谢、能量代谢和溶血磷脂酰胆碱代谢均下调,提示过度疲劳因素可能加重并加速动脉粥样硬化的形成进程。在中药药效评价研究中,成功地采用基于液质联用技术的代谢组学方法并结合聚类分析和相似度评价方法评价了中药通心络对动脉粥样硬化、过度疲劳、抑郁和抑郁-动脉粥样硬化模型的预防作用,并推测其可能的作用机制。比较了通心络和西药辛伐他汀对动脉粥样硬化模型、通心络和人参对过度疲劳模型、通心络和薤白对抑郁模型大鼠的作用差异。发现通心络对上述疾病模型均起到一定的预防作用,且通心络和辛伐他汀、通心络和薤白对大鼠的整体干预作用相当,但其作用机制有所差异。人参对过度疲劳形成的干预作用优于通心络,二者通过调节大鼠体内不同的代谢途径而起到预防作用。