本研究以70个观赏海棠种(品种)为试材,从表型、生理、分子水平进行遗传多样性分析,旨在揭示其差异的内在原因,为海棠种质资源的保护、开发及利用、创新提供参考和依据。主要结果如下:1.表型多样性选取果实、花朵、枝叶的共22个表型性状进行测定,并对其质量性状进行描述。结果显示,观赏海棠不同品种间表型性状差异极显著,变异系数为5.69%~70.30%,果实、花朵、枝叶描述性状多样;主成分分析表明,花朵大小、果实大小和枝条长度等性状是引起品种间表型性状变异的主要因素。2.生理多样性通过对果实内在品质指标、叶片叶绿素和光合参数及枝条相对电导率的测定表明,供试品种属于风味极酸、品质极差类型,品种间差异显著;叶绿素含量差异显著,光合参数差异不显著,叶绿素含量与净光合速率呈显著正相关,可以反映植株光合能力的强弱;通过相对电导率计算其半致死温度,显示供试海棠品种抗寒性极强。3.DNA多样性从67对SSR引物中筛选出20对谱带清晰、多态性好的引物对70个种(品种)进行试验,品种间遗传多样性指数平均值为0.411、杂合度为0.821、遗传多样性信息含量为0.308;聚类将亲缘关系近的种(品种)归为一类,苹果栽培品种聚为一类,?白花?垂丝海棠、西府海棠、滇池海棠、西蜀海棠与北美品种亲缘关系相对较近。表型性状与分子水平的聚类结果显示出一致性但也有一定差异。